معلومة

MHC مقيد الببتيد

MHC مقيد الببتيد


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

ما هو الببتيد المقيد MHC؟

لقد حصلت على هذا التعريف من ويكيبيديا ، لكن لا يمكنني استخلاص بالضبط ما تعنيه عبارة MHC المقيدة الببتيد.

يشير التعرف على المستضد المقيد من معقد التوافق النسيجي الكبير ، أو تقييد MHC ، إلى حقيقة أن خلية تائية معينة ستتعرف على مستضد ببتيد فقط عندما تكون مرتبطة بجزيء معقد التوافق النسيجي الكبير الخاص بالجسم المضيف. عادةً ، نظرًا لأنه يتم تحفيز الخلايا التائية فقط في وجود جزيئات معقد التوافق النسيجي الكبير الذاتي ، يتم التعرف على المستضد فقط كببتيدات مرتبطة بجزيئات معقد التوافق النسيجي الكبير الذاتية.

لم أدرس علم الأحياء منذ السنوات الثماني الماضية ، وأنا الآن أخوض فيه لأنني أحتاجه لبحثي. لذلك إذا كان بإمكان شخص ما وصفها بلغة بسيطة ، فسيكون ذلك مفيدًا للغاية.


بادئ ذي بدء ، يشير MHC إلى مجمع التوافق النسيجي الرئيسي. هناك نوعان من معقد التوافق النسيجي الكبير.

النوع الأول من معقد التوافق النسيجي الكبير موجود في جميع خلايانا بنواة. الغرض من هذه المجمعات البروتينية يسمى عرض المستضد. لا تستطيع الخلايا التائية التعرف على المستضدات الحرة من تلقاء نفسها ، يجب تقديمها لهم بالطريقة الصحيحة. هذا ما تفعله هذه البروتينات. يوجد في كل خلية الكثير والكثير من البروتينات التي يتم هضمها إلى عديد ببتيدات صغيرة (سلاسل قصيرة من الأحماض الأمينية) عن طريق البروتياز أثناء عملية إعادة التدوير الطبيعية. تأخذ الخلية جزءًا صغيرًا من هذه البولي ببتيدات وتقدمها على سطحها من خلال مجمعات معقد التوافق النسيجي الكبير I ، والتي يمكن لجهاز المناعة قراءتها. هذا مشابه لما تقوله الخلية للجهاز المناعي "مرحباً ، لقد حصلت على هذه البروتينات بداخلي". الآن إذا كانت الخلية مصابة (على الأرجح بفيروس) ، يتم هضم بروتينات "المهاجم" وعرضها أيضًا ويكون الأمر أشبه بقول "مرحبًا ، أنا مصاب والمهاجم لديه هذه البروتينات".

يخدم MHC II وظيفة مماثلة ولكنها موجودة فقط في خلايا تقديم المستضد المهنية (APCs). تقدم هذه المجمعات الببتيدات المشتقة من البروتينات المستهلكة والهضم من خلال البلعمة أو الالتقام الخلوي بوساطة المستقبل. إنه مثل قول "مرحبًا ، لدينا مهاجم أكبر ولديه هذه البروتينات"

لذلك ، لا تستطيع الخلايا التائية القصيرة الطويلة التعرف على المستضدات من تلقاء نفسها ، لذا يجب تقديمها لها في مجمعات معقد التوافق النسيجي الكبير وعندئذ فقط يمكن تنشيطها.

تحرير: قائمة بالمقالات المفيدة في موضوع معالجة / عرض المستضد لمزيد من التفاصيل:

14 يناير 1998 14:59 المراجعات السنوية AR052-12 Annu. القس إمونول. 1998. 16: 323-58 آليات معالجة ANTIGEN من الدرجة الأولى MHC Eric Pamer و Peter Cresswell

الخلية ، المجلد. 76 ، 287-299 ، 28 يناير 1994. معالجة المستضد المعتمد على MHC وعرض الببتيد: توفير الروابط لتنشيط الخلايا اللمفاوية التائية

تيري واي ناكاجاوا ، أليكسايدر واي كودنسكي دور البروتينات الليزوزومية في معالجة وعرض مستضد بوساطة من فئة معقد التوافق النسيجي الكبير وعرضه
قد يتطلب هذا الاشتراك.

وصفحة الويكي :)


تتعرف خلايا CD4 + T التنظيمية على حواتم الببتيد المقيدة MHC-II من صميم البروتين B

تلعب خلايا CD4 + T دورًا مهمًا في تصلب الشرايين ، لكن خصوصية المستضد الخاص بها غير مفهومة جيدًا. من المعروف أن التحصين بالبروتين الشحمي B (ApoB ، البروتين الأساسي للبروتين الدهني منخفض الكثافة) هو عامل مضاد لتصلب الشرايين في النماذج الحيوانية. هنا ، نُبلغ عن ببتيد APOB بشري ، p18 ، وهو متطابق في التسلسل في الماوس ApoB ويرتبط بكل من الماوس والبشر MHC-II.

أساليب

قمنا ببناء p18-tetramers لاكتشاف الخلايا التائية الخاصة بـ APOB للإنسان والفأر وقمنا بمعايرة النمط الظاهري عن طريق قياس التدفق الخلوي بما في ذلك عوامل نسخ سلالة CD4 ، السيتوكينات داخل الخلايا ، وتنشيط TCR. أبوي & # x02212 / & # x02212 تم تحصين الفئران بالببتيد p18 أو المواد المساعدة وحدها وتم تحديد عبء تصلب الشرايين في الشريان الأورطي.

نتائج

في الخلايا أحادية النواة في الدم البشري المحيطي من المتبرعين بدون أمراض القلب والأوعية الدموية (CVD) ، كانت خلايا CD4 + T الخاصة بـ p18 المكتشفة بواسطة رباعيات HLA-DR-p18 جديدة في الغالب من خلايا Foxp3 + T التنظيمية (Tregs). المتبرعون المصابون بأمراض القلب والأوعية الدموية تحت الإكلينيكي كما تم الكشف عنهم بواسطة الموجات فوق الصوتية للشريان السباتي ، شارك تريجس في التعبير عن ROR & # x003b3t أو T-bet وكلاهما كان غائبًا تقريبًا في المتبرعين بدون أمراض القلب والأوعية الدموية. في أبوي & # x02212 / & # x02212 الفئران ، التحصين مع p18 Tregs المستحثة وتقليل آفات تصلب الشرايين. بعد إعادة تنشيط الببتيد ، تم إثراء خلايا CD4 + T المستجيبة التي حددها Nur77-GFP في Tregs. حدد فأر جديد I-A b -p18 tetramer توسع خلايا CD4 + T الخاصة بـ p18 عند التطعيم ، والتي تم تخصيبها لـ Tregs المنتجة لـ IL-10.

استنتاج

تظهر هذه النتائج أن خلايا CD4 + T الخاصة بـ APOB p18 هي خلايا Tregs في المتبرعين الأصحاء ، ولكنها تشارك في التعبير عن عوامل نسخ سلالة CD4 الأخرى في المتبرعين المصابين بأمراض القلب والأوعية الدموية تحت الإكلينيكية. تحدد هذه الدراسة ApoB peptide 18 باعتباره أول حاتمة Treg في تصلب الشرايين لدى الإنسان والفأر.


القانون الثاني: تقييد MHC ومفاهيم أوسع للخصوصية المناعية

أظهر المحققون بوضوح أن TCR معين يمكنه التعرف على نفس جزيء MHC الذاتي الذي يقدم أكثر من ببتيد مستضد اسمي واحد مع تقارب متفاوت أعلى من بعض العتبة اللازمة للسماح بنقل الإشارة عبر TCR / CD3 والتنشيط الخلوي (3،37). لذلك ، فإن خصوصية TCR للمستضد ، مثل خصوصية الجسم المضاد للمستضد ، ليست مطلقة ، كما تمت مناقشته سابقًا في مناقشة أنواع HLA الفائقة وكما تم تناوله لاحقًا في مناقشة كيفية التوفيق بين تقييد MHC والفعالية العالية لاستجابات المناعة الخيفية بواسطة كل من CD4 + و CD8 + الخلايا التائية.

في السابق ، اقترحت (14) أن الخصوصية المناعية هي في الواقع مجموعة من المفاهيم ، بما في ذلك الخصوصية المحددة فيما يتعلق بـ: (1) التعرف الأحادي التكافؤ ، (2) التعرف متعدد التكافؤ ، (3) التنشيط الخلوي ووظيفة المستجيب ، و (4) نقاط النهاية التي هي نتيجة لعمل جهاز المناعة بأكمله. في استكشاف هذا المفهوم ، ركزت على الأجسام المضادة والخلايا اللمفاوية البائية. أود الآن أن أقترح أنه يمكن تطبيق إطار عمل مماثل للتعرف على المستضد المستند إلى TCR والخلايا التائية.

وفقًا لهذا المفهوم ، من المهم التحقيق في كل من أحجام الارتباط بين المجالات المتغيرة TCR ومجمعات MHC / الببتيد المختلفة ومعرفة مدى تنبؤها بإجراءات تنشيط الخلايا التائية ووظيفتها. أسباب توقع بعض الانحرافات عن الارتباط المطلق بين تقارب ربط TCR والأنماط الظاهرية الخلوية لا تتضمن فقط تعقيدات نقل الإشارة من خلال مجمع TCR / CD3 ولكن أيضًا المساهمات في التنشيط الخلوي لنقل الإشارة من خلال مستقبلات أخرى على سطح الخلية التائية ، مثل CD4 أو CD8 و CD28 والعديد من البروتينات السكرية الأخرى على سطح الخلية التي تحتوي على روابط على الخلايا العارضة للمستضد. هناك طريقة أخرى لتوضيح هذه النقطة وهي أن الخصوصية التي يتم تقييمها فقط من خلال الاختبارات الملزمة التي تتضمن روابط TCR و MHC / الببتيد قد تختلف عن الخصوصية كما تم تقييمها على أساس مقاييس السلوك الخلوي.

تتوافق النقطة السابقة أيضًا مع نتائج التجارب التي تستخدم ما يسمى "بروابط الببتيد المتغيرة" ، والتي تتوافق مع الببتيدات الاسمية للمستضد مع واحد أو عدد صغير من بدائل الأحماض الأمينية. في عام 1991 ، أظهر Evavold و Allen ، باستخدام نموذج الفأر ، أن بعض هذه الببتيدات عند تقديمها بواسطة جزيء MHC من الدرجة الثانية المناسب إلى مجموعة نسيليه من خلايا CD4 + T الخاصة لنفس عنصر تقييد MHC والببتيد المشابه يمكن أن يستنبط نطاقًا من استجابات الخلايا التائية التي تختلف في جانب واحد أو أكثر عن الاستجابات التي يسببها التعرف على يجند MHC / الببتيد المشابه (8). في تجاربهم عام 1991 ، أدى التحفيز باستخدام معقد مستضد الببتيد / MHC المتغير إلى إنتاج السيتوكين ولكن ليس التكاثر النسيلي ، بينما أدى التحفيز باستخدام الترابط المشابه إلى إنتاج السيتوكين والانتشار النسيلي.

أظهر العمل اللاحق على مر السنين منذ عام 1991 أن تحفيز الخلايا التائية النسيليّة بواسطة روابط الببتيد المتغيرة التي تقدمها جزيئات معقد التوافق النسيجي الكبير المتشابه يمكن أن تثير استجابات متنوعة تتوافق مع أنواع مختلفة من النغمة الجزئية لتضاد تنشيط الخلايا التائية (5). لذلك ، استنتج المحققون في هذه الظواهر بشكل مناسب أن نقل الإشارة من خلال مجمع TCR-CD3 يمكن أن يختلف في مجموعة متنوعة من الطرق التي تؤدي إلى مجموعات مميزة من المخرجات الوظيفية.

مجموعة أخرى من الأفكار المتعلقة بالتفاعلات الجزيئية التي طبقتها صراحة على كيفية التعرف على الأجسام المضادة للمستضدات يمكن تطبيقها بالتساوي على التعرف على مجمعات MHC / الببتيد بواسطة TCRs. في سلسلة من المنشورات (13،16،17) بدأت في أوائل التسعينيات ، اقترحت أن مصطلح "epitope" يمكن ربطه بثلاثة معاني تشغيلية على الأقل. لأغراض هذه المناقشة ، سأفترض أن كلا من المستقبلات والرابطات عبارة عن بروتينات تتكون من أحماض أمينية.

هذه الحواس الثلاثة لـ "epitope" في سياق تقييد MHC هي: (1) مجموعة HLA وبقايا الأحماض الأمينية الببتيدية للمستضد الاسمية التي تجعل فان دير فالس تلامس مع بقايا TCR ، (2) مجموعة MHC / ببتيد الببتيد الذي تساهم بشكل كبير في الطاقة الحرة للتكوين المعقد كما يتم تقييمها عادةً من خلال استبدال الأحماض الأمينية (وسيلة مفيدة ولكنها ليست دائمًا وسيلة مباشرة) ، و (3) مجموعة مخلفات MHC / الببتيد التي تساهم بشكل كبير في الطاقة الحرة التفاضلية للتكوين المعقد بالنظر إلى TCR عند مقارنة مجمعات MHC / الببتيد المتشابه وغير المشابه. تنشأ ضرورة التعريف الثالث جزئيًا من حقيقة أن بقايا الأحماض الأمينية لمركب MHC / الببتيد المشابه قد تكون مساهمة ضعيفة أو محايدة بشكل فعال فيما يتعلق بالطاقة للتفاعل مع TCR ذي الصلة ، ولكن حمض أميني مختلف في قد يعارض نفس الموقف في مجمع MHC / الببتيد غير المشابه تفاعلًا كبيرًا. في هذه الحالة ، تكون البقايا المعنية في الترابط المتشابه مكونًا غير مهم للحلقة في المعنى 2 ولكنها مهمة بالمعنى 3.

إن التحليل الشامل لهذه الأفكار المطبقة على النطاق الكامل لتفاعلات TCR-MHC / الببتيد التي تتضمن مستضدات قياسية أو اسمية بالإضافة إلى المستضدات الرئيسية والثانوية خارج نطاق هذه المقالة. كان هدفي هنا هو توضيح العلاقة بين أفكاري حول تعقيدات التعرف المناعي وتلك الخاصة ببيتر ورولف على أساس خصوصية الخلايا التائية.


مراجع

Zinkernagel ، R. M. & amp Doherty ، P. C. تقييد السمية الخلوية في المختبر بواسطة الخلايا التائية في التهاب السحايا المشيمية اللمفاوية داخل نظام سينجينيك أو شبه منطقي. طبيعة سجية 248, 701–702 (1974).

Hedrick، S.M، Cohen، D. I.، Nielsen، E.A & amp Davis، M. M. عزل استنساخ (كدنا) الذي يشفر البروتينات المرتبطة بالغشاء الخاص بالخلايا التائية. طبيعة سجية 308, 149–153 (1984).

ياناجي ، واي وآخرون. يشفر استنساخ (كدنا) الخاص بالخلايا التائية البشرية بروتينًا له تماثل واسع النطاق لسلاسل الغلوبولين المناعي. طبيعة سجية 308, 145–149 (1984).

روسجون ، جيه وآخرون. التعرف على مستقبلات مستضد الخلايا التائية لجزيئات تقديم المستضد. Annu. القس إمونول. 33, 169–200 (2015).

Rudolph، M.G، Stanfield، R.L & amp Wilson، I.A. كيف تربط TCRs MHCs والببتيدات والمستقبلات. Annu. القس إمونول. 24, 419–466 (2006).

van der Merwe ، P. A. & amp Dushek ، O. آليات تنشيط مستقبل الخلايا التائية. نات. القس إمونول. 11, 47–55 (2011).

Feng، D.، Bond، C.J، Ely، L.K، Maynard، J. & amp Garcia، K. نات. إمونول. 8, 975–983 (2007). توفر هذه الدراسة أول دليل هيكلي على كودون التفاعل.

جارسيا ، ك. سي ، آدامز ، ج. ج. ، فينج ، د. & أمبير إيلي ، إل ك. الأساس الجزيئي لتحيز السلالة الجرثومية لـ TCR لـ MHC بسيط بشكل مدهش. نات. إمونول. 10, 143–147 (2009).

Marrack، P.، Scott-Browne، J.P، Dai، S.، Gapin، L. & amp Kappler، J.W. Annu. القس إمونول. 26, 171–203 (2008).

سكوت براون ، J. P. ، White ، J. ، Kappler ، J.W. ، Gapin ، L. & amp Marrack ، P. طبيعة سجية 458, 1043–1046 (2009).

Yin و L. و Scott-Browne و J. و Kappler و J.W و Gapin و L. & amp Marrack و P. T cells وهوسهم القديم بـ MHC. إمونول. القس. 250, 49–60 (2012).

جيرن ، إن ك. الجيل الجسدي للتعرف المناعي. يورو. J. إمونول. 1, 1–9 (1971).

Rangarajan، S. & amp Mariuzza، R.A. انحياز مستقبل الخلايا التائية لـ MHC: التطور المشترك أم المستقبلات المشتركة؟ زنزانة. مول. علوم الحياة. 71, 3059–3068 (2014).

تيخونوفا ، أ.ن. وآخرون. تمتلك مستقبلات الخلايا الأبجدية التائية التي لا تخضع للتوافق النسيجي الرئيسي لانتقاء الغدة الصعترية النوعية المعقدة خصائص تمييز تشبه الأجسام المضادة. حصانة 36, 79–91 (2012).

فان لاثيم ، إف وآخرون. يسمح حذف مستقبلات CD4 و CD8 بتوليد خلايا alphabetaT التي تتعرف على المستضدات بشكل مستقل عن معقد التوافق النسيجي الكبير. حصانة 27, 735–750 (2007).تقدم هذه الدراسة دليلاً على نظرية الاختيار للتعرف على TCR.

فان لاثيم ، إف وآخرون. يحدد توافر Lck أثناء اختيار الغدة الصعترية خصوصية التعرف على ذخيرة الخلايا التائية. زنزانة 154, 1326–1341 (2013).

يتم فرض قيود Van Laethem و F. و Tikhonova و A.N & amp Singer و A. MHC على مجموعة متنوعة من مستقبلات الخلايا التائية بواسطة مستقبلات CD4 و CD8 أثناء اختيار الغدة الصعترية. اتجاهات إمونول. 33, 437–441 (2012).

Yewdell، J.W & amp Haeryfar، S. M. فهم عرض المستضدات الفيروسية لخلايا CD8 + T في الجسم الحي: مفتاح التصميم العقلاني للقاح. Annu. القس إمونول. 23, 651–682 (2005).

Petersen، J.، Purcell، A. & amp Rossjohn، J. حواتم الخلايا التائية المعدلة بعد متعدية: التعرف المناعي والعلاج المناعي. جيه مول. ميد. 87, 1045–1051 (2009).

Godfrey، D. I.، Uldrich، A. P.، McCluskey، J.، Rossjohn، J. & amp Moody، D.B. الأسرة المزدهرة من الخلايا التائية غير التقليدية. نات. إمونول. 16, 1114–1123 (2015).

Van Rhijn ، I. ، Godfrey ، D. I. ، Rossjohn ، J. & amp Moody ، D.B. نات. القس إمونول. 15, 643–654 (2015).

Rossjohn، J.، Pellicci، D.G، Patel، O.، Gapin، L. & amp Godfrey، D. I. التعرف على مستضدات CD1d المقيدة بواسطة الخلايا التائية القاتلة الطبيعية. نات. القس إمونول. 12, 845–857 (2012).

بيوركمان ، ب.جيه وآخرون. هيكل مستضد التوافق النسيجي من الصنف الأول البشري ، HLA-A2. طبيعة سجية 329, 506–512 (1987).

بوروز ، إس آر ، روسجون ، جيه آند مكلوسكي ، ج. اتجاهات إمونول. 27, 11–16 (2006).

براون ، جيه وآخرون. هيكل ثلاثي الأبعاد لمستضد التوافق النسيجي من الدرجة الثانية البشري HLA-DR1. طبيعة سجية 364, 33–39 (1993).

Adams، E.J & amp Luoma، A.M. طية معقد التوافق النسيجي الرئيسي القابل للتكيف (MHC): بنية ووظيفة الجزيئات الشبيهة بالفئة الأولى غير الكلاسيكية ومعقد التوافق النسيجي الكبير. Annu. القس إمونول. 31, 529–561 (2013).

هندرسون ، ك.ن. وآخرون. أساس هيكلي ومناعي لدور مستضد كريات الدم البيضاء البشرية DQ8 في مرض الاضطرابات الهضمية. حصانة 27, 23–34 (2007).

سميث ، ك.جيه وآخرون. تم الكشف عن موضع متغير للحلزون alpha 2 من فئة MHC I بواسطة التركيب البلوري لـ HLA-B * 3501. حصانة 4, 203–213 (1996).

تينان ، إف إي وآخرون. الهياكل عالية الدقة للحلمات الفيروسية المنتفخة للغاية المرتبطة بمركب التوافق النسيجي الرئيسي من الفئة الأولى. الآثار المترتبة على ارتباط مستقبلات الخلايا التائية والمناعة المناعية للخلايا التائية. J. بيول. تشيم. 280, 23900–23909 (2005).

Turner، S. J.، Doherty، P. C.، McCluskey، J. & amp Rossjohn، J. المحددات الهيكلية لتحيز مستقبل الخلايا التائية في المناعة. نات. القس إمونول. 6, 883–894 (2006).

Lefranc ، M. P. IMGT ، قاعدة بيانات ImMunoGeneTics الدولية. الدقة الأحماض النووية. 29, 207–209 (2001).

Davis، M. & amp Bjorkman، P. J. T- جينات مستقبلات مستضد الخلايا التائية والتعرف على الخلايا التائية. طبيعة سجية 334, 395–402 (1988).

McDonald، B. D.، Bunker، J. J.، Erickson، S.A، Oh-Hora، M. & amp Bendelac، A. Crossreactive alphabeta T cell receptive alphabeta T cell receptive alphabeta T cell receptive of the thymocyte negative selection. حصانة 43, 859–869 (2015).

Merkenschlager، M. et al. كم اختبار اختبار الخلايا التوتية للاختيار؟ J. إكسب. ميد. 186, 1149–1158 (1997).

Sinclair، C.، Bains، I.، Yates، A.J & amp Seddon، B. موت الخلايا الصعترية غير المتكافئة يكمن وراء نسبة الخلايا التائية CD4: CD8 في جهاز المناعة التكيفي. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 110، E2905 – E2914 (2013).

Zerrahn، J.، Held، W. & amp Raulet، D.H. تفاعل MHC في ذخيرة الخلايا التائية قبل الاختيار الإيجابي والسلبي. زنزانة 88, 627–636 (1997).

هسيبي ، إي إس وآخرون. كيف تصبح ذخيرة الخلايا التائية محددة بالببتيد ومعقد التوافق النسيجي الكبير. زنزانة 122, 247–260 (2005).

Ignatowicz، L.، Kappler، J. & amp Marrack، P. ذخيرة الخلايا التائية التي شكلتها ليجند واحد معقد التوافق النسيجي الكبير / الببتيد. زنزانة 84, 521–529 (1996).

Chu ، H. H. ، Moon ، J. J. ، Kruse ، A.C ، Pepper ، M. & amp Jenkins ، M.K يحدد الاختيار السلبي وكيمياء الببتيد حجم مجموعات الخلايا CD4 + T. J. إمونول. 185, 4705–4713 (2010).

هوسيبي ، إي إس ، كروفورد ، إف ، وايت ، جيه ، كابلر ، جيه آند ماراك ، بي يضفي الاختيار السلبي خصوصية الببتيد على ذخيرة الخلايا التائية الناضجة. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 100, 11565–11570 (2003).

تيرنر ، ج م وآخرون. يتم توسط تفاعل المنطقة الطرفية N الفريدة من التيروزين كيناز p56lck مع المجالات السيتوبلازمية لـ CD4 و CD8 بواسطة أشكال السيستين. زنزانة 60, 755–765 (1990).

Veillette، A.، Bookman، M. A.، Horak، E. M. & amp Bolen، J.B. ترتبط مستضدات سطح الخلية CD4 و CD8 T بالغشاء الداخلي tyrosine-protein kinase p56lck. زنزانة 55, 301–308 (1988).

Artyomov و M.N و Lis و M. و Devadas و S. و Davis و M. & amp Chakraborty و A.K. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 107, 16916–16921 (2010).

لي ، Q. J. وآخرون. يعزز CD4 حساسية الخلايا التائية للمستضد من خلال تنسيق تراكم Lck في المشبك المناعي. نات. إمونول. 5, 791–799 (2004).

ستيبانيك ، وآخرون. يوفر مسح المستقبلات بواسطة مستقبلات الخلايا التائية آلية لتحمل الخلايا التائية. زنزانة 159, 333–345 (2014).

سكوت براون ، جي بي وآخرون. تساهم الميزات المحفوظة تطوريًا في خصوصية مستقبلات الخلايا التائية. حصانة 35, 526–535 (2011).

هولاند ، س.جيه وآخرون. مستقبل الخلايا التائية ليس مثبتًا لإشراك روابط معقد التوافق النسيجي الكبير. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 109، E3111 – E3118 (2012).

سيلبرمان ، د. وآخرون. الفئة الثانية من الفئران الطافرة المعقدة ذات التوافق النسيجي الرئيسي لدراسة تحيز الخط الجرثومي لمستقبلات مستضد الخلايا التائية. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 113، E5608 – E5617 (2016).

Garboczi ، D. N. et al. هيكل المركب بين مستقبلات الخلايا التائية البشرية والببتيد الفيروسي و HLA-A2. طبيعة سجية 384, 134–141 (1996).

جارسيا ، ك.سي وآخرون. هيكل مستقبلات الخلايا الأبجدية التائية عند 2.5A واتجاهها في مجمع TCR-MHC. علم 274, 209–219 (1996). توفر المراجع 49 و 50 اللقطات الجزيئية الأولى لتفاعل TCR-pMHC.

جارسيا ، ك.سي وآخرون.الأساس الهيكلي لللدونة في التعرف على مستقبلات الخلايا التائية لمستضد الببتيد الذاتي معقد التوافق النسيجي الكبير. علم 279, 1166–1172 (1998).

دينغ ، واي إتش وآخرون. يرتبط اثنان من مستقبلات الخلايا التائية البشرية في وضع قطري مماثل لمركب الببتيد HLA-A2 / Tax باستخدام أحماض أمينية مختلفة من TCR. حصانة 8, 403–411 (1998).

مانينغ ، تي سي وآخرون. طفرات مسح الألانين لمستقبلات الخلايا التائية ألفا: رسم خرائط طاقة التعرف على المستضد. حصانة 8, 413–425 (1998).

رينهيرز ، إي إل وآخرون. التركيب البلوري لمستقبلات الخلايا التائية معقد مع الببتيد ومعقد التوافق النسيجي الكبير من الدرجة الثانية. علم 286, 1913–1921 (1999).

Reiser ، J.B et al. تخضع حلقة CDR3beta لمستقبل الخلايا التائية لتغييرات توافقية ذات حجم غير مسبوق عند الارتباط بمركب ببتيد / معقد التوافق النسيجي الكبير من الدرجة الأولى. حصانة 16, 345–354 (2002).

Reiser ، J.B et al. تساهم مرونة حلقة CDR3 في تدهور التعرف على TCR. نات. إمونول. 4, 241–247 (2003).

Kjer-Nielsen، L. et al. أساس هيكلي لاختيار مستقبلات الخلايا الأبجدية التائية السائدة في المناعة المضادة للفيروسات. حصانة 18, 53–64 (2003).

ستيوارت جونز ، جي بي ، ماكمايكل ، إيه جي ، بيل ، جي آي ، ستيوارت ، دي آي أند جونز ، إي واي أساس هيكلي للتعرف على مستقبلات الخلايا التائية البشرية المناعية. نات. إمونول. 4, 657–663 (2003).

Archbold ، J. K. et al. يوفر التشكل المكروي الطبيعي في مستضدات الكريات البيض البشرية أساسًا للتحكم الجيني في التعرف على المستضد. J. إكسب. ميد. 206, 209–219 (2009).

دينغ ، ل. وآخرون. الأساس الهيكلي للتعرف على الذات الطافرة من خلال مستقبلات الخلايا التائية المقيدة بالورم من الفئة الثانية من معقد التوافق النسيجي الكبير. نات. إمونول. 8, 398–408 (2007).

Chen، J.L et al. الأساس الهيكلي والحركي لزيادة المناعة للقاحات الخلايا التائية. J. إكسب. ميد. 201, 1243–1255 (2005).

كولف ، إل إيه وآخرون. كيف يتعرف مستقبل خلية تائية واحدة على معقد التوافق النسيجي الكبير الذاتي والأجنبي. زنزانة 129, 135–146 (2007).

ماكدونالد ، دبليو إيه وآخرون. التعرف على الخلايا التائية عن طريق التقليد الجزيئي. حصانة 31, 897–908 (2009). تصف المراجع 62 و 63 الأساس الجزيئي لنشاط الخلايا التائية alloreactivity.

Hahn، M.، Nicholson، M. J.، Pyrdol، J. & amp Wucherpfennig، K.W. نات. إمونول. 6, 490–496 (2005). توفر هذه الدراسة أول نظرة ثاقبة للتفاعل الذاتي بين TCR-pMHC.

لي ، واي وآخرون. هيكل من المناعة الذاتية للإنسان TCR مرتبط بالببتيد الذاتي لبروتين المايلين الأساسي وجزيء MHC من الدرجة الثانية مرتبط بالتصلب المتعدد. EMBO J. 24, 2968–2979 (2005).

بوربوليفيتش ، O. Y. وآخرون. تفاعلية عبر مستقبلات الخلايا التائية الموجهة بواسطة الضبط المعتمد على المستضد للمرونة الجزيئية للببتيد- معقد التوافق النسيجي الكبير. حصانة 31, 885–896 (2009).

تينان ، إف إي وآخرون. يعمل مستقبل الخلايا التائية على تسطيح الببتيد المستضد المنتفخ الذي يقدمه جزيء من الدرجة الأولى معقد التوافق النسيجي. نات. إمونول. 8, 268–276 (2007).

تينان ، إف إي وآخرون. التعرف على مستقبلات الخلايا التائية لمركب التوافق النسيجي الرئيسي "منتفخ للغاية" من الفئة الأولى من الببتيد. نات. إمونول. 6, 1114–1122 (2005).

بوروز ، إس آر وآخرون. يتم دعم الأسلاك الصلبة لخصوصية مستقبلات الخلايا التائية لمركب التوافق النسيجي الرئيسي من خلال القدرة على التكيف مع TCR. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 107, 10608–10613 (2010).

تيرنر ، إس جيه وآخرون. يحد عدم وجود ميزات معقدة التوافق النسيجي الرئيسية الببتيدية من تنوع الذخيرة في مجموعات خلايا CD8 + T الخاصة بالفيروس. نات. إمونول. 6, 382–389 (2005).

داي ، إي بي وآخرون. الأساس الهيكلي لتمكين تنوع مستقبلات الخلايا التائية داخل استجابات خلايا CD8 + T. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 108, 9536–9541 (2011).

Gras، S.، Kjer-Nielsen، L.، Burrows، S.R، McCluskey، J. & amp Rossjohn، J. T-cell receptor bias and immunity. بالعملة. رأي. إمونول. 20, 119–125 (2008).

بورج ، إن إيه وآخرون. تحدد مناطق CDR3 لمستقبلات الخلايا التائية المناعية "المشهد النشط" للتعرف على الببتيد-معقد التوافق النسيجي الكبير. نات. إمونول. 6, 171–180 (2005).

جراس ، إس وآخرون. تشكيل التعرف على مستقبلات الخلايا التائية من خلال التسامح الذاتي. حصانة 30, 193–203 (2009).

داي ، إس وآخرون. تسلط الخلايا التائية التفاعلية المتقاطعة الضوء على قواعد السلالة الجرثومية لتفاعلات مستقبلات الخلايا التائية [ألفا] [بيتا] مع جزيئات معقد التوافق النسيجي الكبير. حصانة 28, 324–334 (2008).

بلفينز ، إس جيه وآخرون. كيف توجد القدرة على التكيف الهيكلي جنبًا إلى جنب مع تحيز HLA-A2 في ذخيرة الأبجدية البشرية TCR. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 113، E1276-E1285 (2016).

بيرمان ، هـ.م وآخرون. بنك بيانات البروتين. الدقة الأحماض النووية. 28, 235–242 (2000).

لادل ، ك وآخرون. أساس جزيئي للتحكم في متغيرات هروب المناعة السابقة بواسطة خلايا CD8 + T الخاصة بفيروس نقص المناعة البشرية. حصانة 38, 425–436 (2013).

بيترسن ، جيه وآخرون. محددات اختيار الخلايا التائية الخاصة بالجليدين في مرض الاضطرابات الهضمية. J. إمونول. 194, 6112–6122 (2015).

بروتون ، إس إي وآخرون. يرتبط استخدام مستقبلات الخلايا التائية المتحيزة الموجه ضد مستضد كريات الدم البيضاء البشرية المقيدة ببتيدات جليادين DQ8 بمرض الاضطرابات الهضمية. حصانة 37, 611–621 (2012).

بيترسن ، جيه وآخرون. التعرف على مستقبلات الخلايا التائية لمجمعات HLA-DQ2-gliadin المرتبطة بمرض الاضطرابات الهضمية. نات. هيكل. مول. بيول. 21, 480–488 (2014).

جراس ، إس وآخرون. أساس هيكلي لاستخدام αβTCR المتنوع ضد مستضد EBV المناعي المقيد بجزيء HLA-B8. J. إمونول. 188, 311–321 (2012).

جراس ، إس وآخرون. تعدد الأشكال الأليلي في مستقبلات الخلايا التائية وتأثيره على الاستجابات المناعية. J. إكسب. ميد. 207, 1555–1567 (2010).

سيثي ، دي ك وآخرون. يؤدي وضع الربط المائل للغاية بواسطة مستقبلات الخلايا التائية ذاتية التفاعل إلى تفاعل متغير للببتيد ومعقد التوافق النسيجي الكبير. J. إكسب. ميد. 208, 91–102 (2011).

Sethi، D.K، Gordo، S.، Schubert، D.A & amp Wucherpfennig، K.W. نات. كومون. 4, 2623 (2013).

يين ، ل. وآخرون. يكشف مستقبل خلية T واحد مرتبط بمركب التوافق النسيجي الرئيسي من الفئة الأولى والبروتينات السكرية من الدرجة الثانية عن محولات TCR القابلة للتحويل. حصانة 35, 23–33 (2011).يصف هذا البحث كيف يمكن لـ TCR ربط جزيئات معقد التوافق النسيجي الكبير من الصنف الأول ومعقد التوافق النسيجي الكبير من الدرجة الثانية.

بوليك ، أ.م وآخرون. الأساس البنيوي لقتل خلايا بيتا البشرية بواسطة خلايا CD8 + T في مرض السكري من النوع 1. نات. إمونول. 13, 283–289 (2012).

ستيوارت جونز ، جي بي وآخرون. السمات الهيكلية الكامنة وراء حساسية مستقبلات الخلايا التائية للأشكال الدقيقة المخفية من الفئة الأولى من معقد التوافق النسيجي الكبير. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 109، E3483 – E3492 (2012).

ليو ، واي سي وآخرون. أساس جزيئي للتفاعل بين الخلايا التائية والطفرات الفيروسية والتشكيل المكروي لمستضد الكريات البيض البشرية. J. بيول. تشيم. 289, 16688–16698 (2014).

بيرنبوم ، إم إي وآخرون. تفكيك خصوصية الببتيد- MHC للتعرف على الخلايا التائية. زنزانة 157, 1073–1087 (2014).

كول ، دي ك وآخرون. يكمن ارتباط مستقبل الخلايا التائية المناعية الذاتية في نقطة ساخنة في تفاعل مسببات الأمراض وببتيد الأنسولين. J. كلين. استثمار. 126, 3626–3626 (2016).

آدامز ، جيه جيه وآخرون. يحدد التفاعل الهيكلي بين تفاعلات السلالة الجرثومية والتعرف التكيفي عرض النطاق الترددي للتفاعلية التبادلية TCR-peptide-MHC. نات. إمونول. 17, 87–94 (2015).

آدامز ، جيه جيه وآخرون. تقتصر إشارات مستقبلات الخلايا التائية على هندسة الالتحام في معقد التوافق النسيجي الرئيسي الببتيد. حصانة 35, 681–693 (2011).

ستادينسكي ، بي دي وآخرون. دور الاقتران الجيني المتغير التفاضلي في إنشاء مستقبلات الخلايا التائية الخاصة بروابط التوافق النسيجي الرئيسية الفريدة. حصانة 35, 694–704 (2011).

كولشو ، إيه وآخرون. يملي انحياز السلالة الجرثومية تفاعل النمط المصلي في استجابة خلايا CD8 + T الخاصة بفيروس حمى الضنك. نات. إمونول. 18, 1228–1237 (2017).

Van Braeckel-Budimir، N. et al. يؤوي موضع مستقبل الخلايا التائية جين الاستجابة المناعية الخاص بالملاريا. حصانة 47, 835–847 (2017).

برينجر ، دي إكس وآخرون. مستقبل الخلايا التائية عكس التعرف على القطبية لمركب التوافق النسيجي الرئيسي للمستضد الذاتي. نات. إمونول. 16, 1153–1161 (2015).

جراس ، إس وآخرون. مستقبلات الخلايا التائية المعكوسة التي ترسو في مركب من الدرجة الأولى من التوافق النسيجي يحد من المشاركة في الاستجابة المناعية. حصانة 45, 749–760 (2016). تبرز المراجع 97 و 98 وجود طبولوجيا لرسو السفن TCR-pMHC المعكوسة.

جارسيا ، ك. سي التوفيق بين وجهات النظر حول تحيز السلالة الجرثومية لمستقبل الخلايا التائية لـ MHC. اتجاهات إمونول. 33, 429–436 (2012).

باريش ، H. L. ، Deshpande ، N. R. ، Vasic ، J. & amp Kuhns ، M. S. دليل وظيفي للخصوصية الجوهرية لـ TCR لـ MHCII. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 113, 3000–3005 (2016).

Yin ، Y. ، Wang ، X. & amp Mariuzza ، R. A. هيكل بلوري لمجمع ثلاثي كامل لمستقبلات الخلايا التائية ، الببتيد- MHC ، و CD4. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 109, 5405–5410 (2012).

هو ، واي وآخرون. تحديد موقع الالتحام لـ CD3 على سلسلة بيتا لمستقبل الخلايا التائية بواسطة محلول الرنين المغناطيسي النووي. J. بيول. تشيم. 290, 19796–19805 (2015).

Li ، Y. ، Yin ، Y. & amp Mariuzza ، R. A. رؤى هيكلية وفيزيائية حيوية حول دور CD4 و CD8 في تنشيط الخلايا التائية. أمام. إمونول. 4, 206 (2013).

Barnd، D.L، Lan، M. S.، Metzgar، R. S. & amp Finn، O. J. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 86, 7159–7163 (1989).

Hanada ، K. ، Wang ، Q. J. ، Inozume ، T. & amp Yang ، J. دم 117, 4816–4825 (2011).

Magarian-Blander ، J. ، Ciborowski ، P. ، Hsia ، S. ، Watkins ، S.C & amp Finn ، O. J. J. إمونول. 160, 3111–3120 (1998).

Rao، A.، Ko، W. W.، Faas، S.J & amp Cantor، H. ملزمة للمستضد في غياب بروتينات التوافق النسيجي عن طريق استنساخ الخلايا التائية المتفاعلة. زنزانة 36, 879–888 (1984).

سيليسيانو ، آر إف وآخرون. دليل مباشر على وجود مواقع ارتباط اسمية لمولد الضد على سطح الخلية التائية Ti alpha-beta heterodimers من استنساخ الخلايا التائية المقيدة بـ MHC. زنزانة 47, 161–171 (1986).

فيريرا ، إم إيه وآخرون. مواضع السمات الكمية لـ CD4: ترتبط نسبة الخلايا الليمفاوية CD8 بخطر الإصابة بمرض السكري من النوع 1 والتحكم المناعي لفيروس HIV-1. أكون. جيه هوم. جينيه. 86, 88–92 (2010).

Gulwani-Akolkar ، B. وآخرون. هل تلعب جينات HLA دورًا بارزًا في تحديد استخدام مستقبلات الخلايا التائية V alpha في البشر؟ J. إمونول. 154, 3843–3851 (1995).

Klarenbeek، P. L. et al. يرتبط التباين الجسدي في جينات مستقبلات الخلايا التائية بشدة بتقييد فئة HLA. بلوس واحد 10، e0140815 (2015).

Sim، B. C.، Zerva، L.، Greene، M.I & amp Gascoigne، N.R. التحكم في تقييد MHC بواسطة TCR Valpha CDR1 و CDR2. علم 273, 963–966 (1996).

روبلت ، إف وآخرون. تؤدي الفروق الوراثية الفردية إلى ذخيرة فريدة من نوعها لمستقبلات الخلايا الليمفاوية للخلايا الساذجة والخلايا ذات الخبرة بالمستضد. نات. كومون. 7, 11112 (2016).

Zvyagin، I. V. et al. تم الكشف عن الخصائص المميزة لذخيرة TCR الخاصة بالتوائم المتطابقة من خلال التسلسل عالي الإنتاجية. بروك. ناتل أكاد. علوم. الولايات المتحدة الأمريكية 111, 5980–5985 (2014).

إيمرسون ، ر.أو وآخرون. يحدد التسلسل المناعي بصمات تاريخ التعرض للفيروس المضخم للخلايا وتأثيرات HLA على ذخيرة الخلايا التائية. نات. جينيه. 49, 659–665 (2017).

شارون ، إي وآخرون. يرتبط التباين الجيني في بروتينات معقد التوافق النسيجي الكبير مع تحيزات التعبير عن مستقبلات الخلايا التائية. نات. جينيه. 48, 995–1002 (2016).

مادي ، إيه وآخرون. تتجمع ذخيرة مستقبلات الخلايا التائية للفئران والبشر في شبكات تشابه حول تسلسلات CDR3 العامة المحفوظة. إليفي 6، e22057 (2017).

داش ، ب. وآخرون. تحدد الميزات التنبؤية القابلة للقياس الكمي ذخيرة مستقبلات الخلايا التائية الخاصة بالحلمة. طبيعة سجية 547, 89–93 (2017).

جلانفيل ، جيه وآخرون. تحديد مجموعات النوعية في ذخيرة مستقبلات الخلايا التائية. طبيعة سجية 547, 94–98 (2017). تبرز المراجع 118 و 119 قوة علم المناعة القائم على الأنظمة في تحديد السمات التي يمكن التنبؤ بها في استجابات TCR.

ماير ، إ. السبب والنتيجة في علم الأحياء. علم 134, 1501–1506 (1961).

ألتمان ، جيه دي وآخرون. تحليل النمط الظاهري للخلايا اللمفاوية التائية النوعية للمستضد. علم 274, 94–96 (1996).

Ding ، Y.H ، Baker ، B. M. ، Garboczi ، D.N ، Biddison ، W.E & amp Wiley ، D.C. أربعة هياكل A6-TCR / peptide / HLA-A2 التي تولد إشارات مختلفة جدًا للخلايا التائية متطابقة تقريبًا. حصانة 11, 45–56 (1999).

Reiser ، J.B et al. التركيب البلوري لمستقبل الخلية التائية المرتبط بجزيء معقد التوافق النسيجي المتعدد. نات. إمونول. 1, 291–297 (2000).

ديجانو م وآخرون. نقطة ساخنة وظيفية للتعرف على المستضد في مجمع TCR / MHC الخارق. حصانة 12, 251–261 (2000).

مون ، جيه جيه وآخرون. يختلف تردد خلية CD4 + T الساذج باختلاف الحلقات ويتوقع تنوع الذخيرة وحجم الاستجابة. حصانة 27, 203–213 (2007). تصف هذه الدراسة الإثراء المغناطيسي القائم على رباعي الأسطوانات ، والذي يتيح الكشف الروتيني عن CD4 الخاص بمستضد معين + و CD8 + الخلايا التائية من الأفراد الساذجين.

روبينز ، إتش إس وآخرون. تقييم شامل لتنوع سلسلة بيتا لمستقبلات الخلايا التائية في خلايا الأبجدية التائية. دم 114, 4099–4107 (2009).

داش ، ب. وآخرون. التحليل المقترن لسلاسل TCRalpha و TCRbeta على مستوى الخلية الواحدة في الفئران. J. كلين. استثمار. 121, 288–295 (2011).

Wang ، G.C ، Dash ، P. ، McCullers ، J. A. ، Doherty ، P. C. & amp Thomas Thomas ، P. G. علوم. ترجمة. ميد. 4، 128ra142 (2012).

كيم ، إس إم وآخرون. تحليل سلاسل ألفا وبيتا TCR المقترنة لخلايا T بشرية واحدة. بلوس واحد 7، e37338 (2012). تصف المراجع 127-129 تحليل سلسلة TCR α وسلسلة β من خلايا مفردة في الفئران والبشر.

Bolotin ، D. A. et al. تسلسل الجيل التالي لتنميط ذخيرة TCR: ميزات خاصة بالمنصة وخوارزميات التصحيح. يورو. J. إمونول. 42, 3073–3083 (2012).

Bolotin ، D. A. et al. MiTCR: برنامج لتحليل بيانات تسلسل مستقبلات الخلايا التائية. نات. أساليب 10, 813–814 (2013).

تورشانينوفا ، إم إيه وآخرون. اقتران سلاسل مستقبلات الخلايا التائية عبر مستحلب PCR. يورو. J. إمونول. 43, 2507–2515 (2013).

Howie ، B. وآخرون. الاقتران عالي الإنتاجية لمستقبلات الخلايا التائية ألفا وبيتا. علوم. ترجمة. ميد. 7، 301ra131 (2015).

ستوبينجتون ، إم جي تي وآخرون. مصير الخلية التائية والاستدلال الاستنساخ من النسخ أحادية الخلية. نات. أساليب 13, 329–332 (2016).


تخرج ببتيدات MHC-I من الأخدود وتمكّن آلية جديدة لهروب HIV-1

تلعب جزيئات الفئة الأولى من معقد التوافق النسيجي الرئيسية (MHC-I) دورًا مهمًا في المناعة عن طريق التقاط الببتيدات لعرضها على الخلايا التائية والخلايا القاتلة الطبيعية (NK). يتم ربط طرف الببتيد داخل أخدود ربط مولد الضد MHC-I ، ولكن من غير المعروف ما إذا كانت أوضاع العرض الأخرى تحدث أم لا. نوضح هنا أن 20 ٪ من مرجع الببتيد HLA-B * 57:01 يشتمل على مجموعات ممتدة نهائية من N تتميز بعنصر مشترك في الموضع 1 (P1) إلى P2. أظهرت هياكل HLA-B * 57:01 التي تقدم الببتيدات الممتدة نهائيًا من N ، بما في ذلك حاتمة HIV-1 Gag TW10 (TSTLQEQIGW) ، أن الطرف N يبرز من أخدود ربط الببتيد. الهروب المشترك TS المتحولةنLQEQIGW المرتبط بـ HLA-B * 57:01 قانونيًا ، اعتمادًا على شكل مختلف تمامًا عن الببتيد TW10. أثر هذا على التعرف على الخلايا القاتلة مثل مستقبلات الغلوبولين المناعي (KIR) 3DL1 المعبر عنها في الخلايا القاتلة الطبيعية. وبالتالي نحدد سمة غير معيّنة سابقًا للببتيد المناعي من الفئة الأولى (HLA-I) لمستضد كريات الدم البيضاء البشرية والتي لها آثار على الهروب المناعي الفيروسي. نقترح كذلك أن التعرف على حاتمة HLA-B * 57: 01-TW10 يحكمه "توتر جزيئي" بين أنظمة المناعة التكيفية والفطرية.


المواد وطرق أمبير

اختيار الطرق

كخطوة أولى ، قمنا بتجميع قائمة بجميع طرق التنبؤ بحلقة الخلايا CD8 + T المتاحة مجانًا من خلال الاستعلام عن Google و Google Scholar. حددنا 44 طريقة (جدول S1) تحتوي على خوارزميات قابلة للتنفيذ متاحة مجانًا للجمهور (باستثناء تلك التي تطلبت منا تدريب نموذج تنبؤ) ، واستبعاد أدوات التنبؤ التجاري التي تطلبت منا الحصول على تراخيص. من بين هذه الطرق الـ 44 ، اخترنا تلك التي تحتوي على نماذج مدربة متاحة لأليلي الماوس اللذين كان لدينا بيانات معيارية لهما (H-2D b & amp H-2K b). علاوة على ذلك ، اتصلنا بمؤلفي الطرق المختارة واستبعدنا تلك التي أراد المؤلفون صراحة استبعادها من القياس لأسباب مختلفة (غالبًا لأن الأساليب لم يتم تحديثها مؤخرًا أو إصدار نسخة جديدة من الأساليب قريبًا). تضمنت القائمة النهائية 15 طريقة تم اختيارها لتضمينها في القياس: ARB [9]، BIMAS [2]، IEDB Consensus [7]، MHCflurry [10]، MHCLovac [11]، NetMHC-4.0 [12]، NetMHCpan -3.0 [13] ، NetMHCpan-4.0 [14] ، PAComplex [15] ، PREDEP [16] ، ProPred1 [17] ، Rankpep [18] ، SMM [19] ، SMMPMBEC [20] ، SYFPEITHI [3]. من بين 15 طريقة ، قدم NetMHCpan-4.0 ناتجين مختلفين ، الأول هو تقارب الربط المتوقع للببتيد (يشار إليه باسم NetMHCpan-4.0-B) ، والثاني الاحتمال المتوقع لكون الببتيد يجند من حيث درجة احتمالية (NetMHCpan-4.0-L). تم تقييم كل من هذه المخرجات بشكل منفصل. وبالمثل ، يمكن لـ MHCflurry استخدام نموذجين مختلفين ، الأول تم تدريبه باستخدام بيانات الربط فقط (MHCflurry-B) والثاني يتضمن بيانات عن الببتيدات المحددة بواسطة قياس الطيف الكتلي (MHCflurry-L). تم تقييم كلا النموذجين بشكل منفصل. بالنظر إلى هذه الطرق كطرق منفصلة ، تم تضمين ما مجموعه 17 طريقة في المعيار ، وتم وصفها بمزيد من التفصيل في جدول S1. اختلفت الطرق بشكل كبير في أطوال الببتيد التي يمكن توقعها لكل أليل. على سبيل المثال ، بينما يمكن لـ MHCLovac التنبؤ بأطوال 7-13 لكلا الأليلين ، يمكن لـ PAComplex التنبؤ بـ 8 أمتار فقط من H-2K b وليس أي من الأطوال في حالة H-2D b. اختلفت الطرق أيضًا في نوع درجات التنبؤ المقدمة ولكنها في النهاية مثلت درجة كانت تهدف إلى الارتباط باحتمالية أن يكون الببتيد حاتمة في سياق جزيء معقد التوافق النسيجي المحدد. يتم إعطاء قائمة كاملة بأطوال الببتيد المسموح بها للتنبؤ لكل أليل بكل طريقة ونوع درجات التنبؤ التي يقدمونها في جدول S2.

مجموعة بيانات ببتيدات VACV

بالنسبة لتحليل المعيار ، استخدمنا مجموعة بيانات الببتيد الموضحة في Croft et al. ، 2019 (جدول S3). تمثل مجموعة البيانات هذه مجموعة شاملة من الببتيدات التي تمت معالجتها بشكل طبيعي واستخراجها من الخلايا المصابة بـ VACV بالإضافة إلى أي حواتم تم تحديدها مسبقًا. تم اختبار إجمالي 220 ببتيدات VACV من أجل الاستجابات المناعية للخلايا التائية في الفئران المصابة. من بين هذه الببتيدات ، تمت إزالة 172 من جزيئات H-2D b و K b من الخلايا المصابة بـ VACV كما هو موضح بالتفصيل في Croft وآخرون ، 2019. باختصار ، خلايا DC2.4 (مشتقة من C57BL / 6 الفئران [21] التي تعبر عن جزيئات H-2 b MHC مصابة بـ VACV. ثم تم عزل جزيئات H-2D b و K b بشكل فردي وإزالة الببتيدات المرتبطة. ثم تم تحليل الببتيدات بواسطة تحليل كروماتوجرافي سائل عالي الدقة - قياس الطيف الكتلي الترادفي (LC-MS / MS) لم يتم الكشف عن الببتيدات المتبقية في المجموعة بواسطة LC-MS / MS وتضمنت 46 ببتيدات / حلقات مقيدة H-2 b مشتقة من VACV من IEDB [22] وواحدة غير منشورة بالكامل وحلقة أخرى تم تعيينها من سلسلة أطول منشورة [23] حددها مختبر تشارك.تم اختبار التفاعل المناعي لكل من هذه الببتيدات البالغ عددها 220 ثم 8 مرات وتم تصنيف الببتيدات التي تم اختبارها إيجابية أكثر من أربع مرات على أنها "حواتم رئيسية" وتم تصنيف تلك التي تم اختبارها إيجابية أربع مرات أو أقل على أنها "حواتم ثانوية". تم تصنيف جميع الببتيدات التي لم تكن إيجابية أبدًا على أنها "غير مناعية". كان هناك 83 ببتيدًا مصنّفًا على أنه إيجابيات "رئيسية" (جدول S3) ، تتراوح أطوالها من 7 إلى 13. بالإضافة إلى 220 من الببتيدات التي تم اختبارها من أجل المناعة ، قمنا بتوليد جميع الببتيدات الممكنة بأطوال 7-13 من البروتين المرجعي لـ VACV (https://www.uniprot.org/proteomes/UP000000344) (ملف S1) ، والتي تم اعتبارها أيضًا غير - مناعة ، بناءً على عدم وجودها في فحوصات الشطف على الخلايا المصابة ، ولم يتم العثور عليها إيجابية في أي من الدراسات العديدة المسجلة في العبوات الناسفة. تتألف مجموعة البيانات بأكملها من 767788 توليفة من الببتيد / الأليل.

تقاييم الأداء

تم تقييم أداء طرق التنبؤ بشكل أساسي من خلال إنشاء منحنيات ROC (منحنى خاصية تشغيل جهاز الاستقبال) وحساب AUCجمهورية الصين (المنطقة الواقعة تحت منحنى منحنى ROC). يوضح منحنى ROC أداء نموذج التنبؤ من خلال رسم المعدل الإيجابي الحقيقي (TPR ، جزء من الإيجابيات الحقيقية من جميع الإيجابيات الحقيقية) مقابل المعدل الإيجابي الكاذب (FPR ، جزء من الإيجابيات الكاذبة من جميع السلبيات الحقيقية) عتبة الدرجة المتوقعة متغيرة. الجامعة الأمريكية بالقاهرةجمهورية الصين هي المنطقة الواقعة تحت منحنى ROC الذي يلخص معلومات المنحنى ويعمل كقيمة واحدة تمثل أداء نظام المصنف. المتنبئ الذي يكون توقعه معادلاً للعشوائية سيكون له AUC = 0.5 في حين أن المتنبئ المثالي سيكون له AUC = 1.0. أي أنه كلما اقتربت AUC من 1.0 ، كانت طريقة التنبؤ أفضل. تم حساب قيم AUC أولاً على مجموعات مختلفة من الببتيدات مجمعة حسب الطول والأليل بشكل منفصل. ثانيًا ، تم حساب إجمالي AUCs من خلال أخذ الببتيدات من جميع الأطوال وكلا الأليلين معًا ، مما يعكس قابلية الاستخدام الواقعية للاضطرار إلى تحديد الببتيدات المراد اختبارها. في هذا الحساب ، تم تخصيص درجات ضعيفة للببتيدات ذات الأطوال حيث لم تكن التنبؤات متاحة لطريقة معينة. على سبيل المثال ، في حالة SMM ، تشير القيم العددية المنخفضة لدرجة التنبؤ إلى مرشحين أفضل للحلقة ، مع درجات تتراوح من 0 إلى 100. لذلك تم تخصيص درجة 999 لجميع الببتيدات ذات الأطوال التي لم تكن التنبؤات متاحة في SMM ( أطوال 7 و 12 و 13 لكلا الأليلين). وبالمثل تم تعيين درجة -100 في حالة SYFPEITHI (H-2D b: 7–8، 11–13 H-2K b: 7، 9–13) حيث تشير القيمة العددية الأعلى للنتيجة المتوقعة إلى مرشح حاتمة أفضل و عشرات تتراوح من -4 إلى 32.

خط أنابيب مؤتمت بالكامل لإنشاء مقاييس معيارية

تم استخدام حزمة Python scikit-Learn [24] لحساب AUCs وحزمة Python matplotlib [25] للتخطيط. برنامج نصي بيثون يمكنه إنشاء جميع النتائج والمؤامرات جنبًا إلى جنب مع ملف الإدخال الذي يحتوي على جميع الببتيدات ودرجات التنبؤ الخاصة بها من كل طريقة ، وفئة الاستمناع ، ودرجات استجابة الخلايا التائية ، و "درجات ثقة ProteinPilot" التي تمثل ثقة تحديد مقياس الطيف الكتلي (MS) يتم توفير مستوى الببتيدات وعدد المرات التي تم فيها تحديد الببتيدات بواسطة MS في مستودع GitLab (https://gitlab.com/iedb-tools/cd8-t-cell-epitope-prediction-benchmarking). يحتوي المستودع أيضًا على مخرجات البرنامج النصي ، أي النتائج والمؤامرات ذات الصلة. سيمكن هذا المستخدمين المهتمين من التحقق من نتائجنا وإضافة خوارزميات التنبؤ الخاصة بهم.


المواد والأساليب

استرجاع التسلسل والتحليلات

تم استرداد تسلسل 56 جينة من الفئة الأولى من معقد التوافق النسيجي الكبير (بما في ذلك الجينات المتوقعة) من الخفافيش من قاعدة بيانات NCBI (جدول S1). تم استرجاع متواليات السلسلة الثقيلة MHC I للثدييات الأعلى من قاعدة بيانات تعدد الأشكال المناعي (IPD) (www.ebi.ac.uk/ipd/mhc) وقاعدة بيانات UniProt (www.uniprot.org). تم تضمين نسخ الجرابيات المودعة سابقًا (الأبوسوم ، تمار والابي ، كوالا ، شيطان تسمانيا) وخلد الماء MHC I في هذه التحليلات (جدول S1). تم إنشاء محاذاة التسلسل باستخدام ClustalX [48] و ESPript [49]. تم حساب أوجه التشابه باستخدام DNAMAN (https://www.lynnon.com/).

تم استرداد البروتينات الخاصة بـ 1000 جينوم لـ MERS-CoV و 1000 جينوم لـ SARS-CoV من GenBank ، على التوالي. بعد محاذاة التسلسل مع MAFFT ، تم اختيار الحمض الأميني المهيمن لكل موقع كتسلسل مرجعي. تردد الطفرة = عدد الطفرات الكلية لكل حمض أميني / (عدد تكرارات الحمض الأميني في التسلسل المرجعي × العدد الإجمالي للتسلسلات).

تخليق الببتيد وإعداد بنيات التعبير

لفحص الببتيدات المحتملة للارتباط بـ Ptal-N * 01:01 ، فإن البروتينات الخاصة بالفيروسات المرتبطة بالخفافيش EBOV (NP: GenBank no. AF054908.1 GP: GenBank no. AKG65250.1) ، MERS-CoV (GenBank no. AXN92228.1) ، فيروس شبيه بالإنفلونزا H17N10 (A / الخفافيش الصفراء الصغيرة / غواتيمالا / 060/2010 (H17N10)) ، وفيروس شبيه بالإنفلونزا H18N11 (A / الخفافيش ذات الوجه المسطح / بيرو / 033/2010 (H18N11 )) للتنبؤ بالببتيدات المرشحة. تم توقع واختيار الببتيدات المرشحة وفقًا للعنصر الذي تم الإبلاغ عنه مؤخرًا ، حيث تم أيضًا تصنيع الببتيدات Ptal-N * 01:01 - الببتيدات الرابطة ، HeV1 و HeV2 ، المشتقة من HeV (جدول S2) [30]. كما تم توقع درجات الربط المحتملة للببتيدات المحددة من خلال خادم NetMHCpan 4.0 عبر الإنترنت (http://www.cbs.dtu.dk/services/NetMHCpan/) [50] و Rosetta FlexPepDock ، والذي يعتمد على نمذجة البنية [51] ، 52] ، حتى نفضل اختيار الببتيدات التي تتوافق مع فكرة Ptal-N * 01:01 [30]. تم تحديد درجة نقاء الببتيد لتكون & gt95٪ بواسطة HPLC التحليلي وقياس الطيف الكتلي. تم تخزين الببتيدات عند -80 درجة مئوية كمساحيق مجففة بالتجميد وتم إذابتها في DMSO قبل الاستخدام.

إن cDNAs للسلسلة الثقيلة من ص. alecto MHC I Ptal-N * 01:01 (GenBank no. KT987929) [30] و bat2م (GenBank رقم XP_006920478.1) تم تصنيعه (Genewiz ، بكين ، الصين). تم إيداع تسلسل Ptal-N * 01: 01 في GenBank بواسطة Wynne وزملاؤه ، وتم تحديد Ptal-N * 01:01 – الببتيدات الرابطة HeV1 و HeV2 في دراستهم [30]. على الرغم من أن نج وزملاؤه أبلغوا عن أول Ptal-N * 01:01 [29] ، فإن التسلسل غير متاح على الإنترنت. للتحقيق في وظيفة Met 52 Asp 53 Leu 54 في Ptal-N * 01:01 ، تم إنشاء طفرة تسمى Ptal-N * 01:01 (-3aa) مع حذف هذه الأحماض الأمينية الثلاثة. المنتجات المكبرة التي تعبر عن المجال خارج الخلية (المخلفات 1-277) لـ Ptal-N * 01:01 و bat2تم استنساخ m (المخلفات 1-98) في ناقل pET28a (Novagen). التعبير البلازميد للإنسان β2م (المخلفات 1-99) تم بناؤها سابقًا في مختبرنا [53].

إعادة تشكيل وتنقية مجمعات الخفافيش من الدرجة الأولى

تم إجراء تجديد وتنقية Ptal-N * 01:01 مجمعة مع الببتيدات كما هو موضح سابقًا [54،55]. بشكل عام ، بات MHC I Ptal-N * 01:01 سلسلة ثقيلة ومضرب β2تم التعبير عن م بشكل مفرط كهيئات إدراج في سلالة BL21 (DE3) من الإشريكية القولونية، وتم إذابة أجسام التضمين المنقى للبروتينات في محلول مؤقت 6 M guanidine-HCl بتركيز 30 مجم / مل. ثم حقن وتخفيف السلسلة الثقيلة من معقد التوافق النسيجي الكبير ، β2م ، وحدث الببتيد بنسبة مولارية 1: 1: 3 في محلول إعادة الطي (100 ملي مولار من حمض الهيدروكلوريك [الرقم الهيدروجيني 8] ، 2 ملي مولار EDTA ، 400 ملي مولار L-Arg ، 0.5 ملي مولار من الجلوتاثيون المؤكسد ، و 5 ملي مولار من الجلوتاثيون المختزل) [34]. بعد 24 ساعة من إعادة تشكيل البروتين ، تم تركيز مجمعات Ptal-N * 01:01 وتبادلها إلى مخزن مؤقت 20 ملي مولار Tris-HCl (الرقم الهيدروجيني 8) و 50 ملي كلوريد الصوديوم ثم تمت تنقيته باستخدام Superdex 200 16/60 HiLoad (GE الرعاية الصحية ، بكين ، الصين) عمود استبعاد الحجم.

التبلور وجمع البيانات ومعالجتها

تم إجراء التبلور باستخدام تقنية نشر بخار قطرة الجلوس. تم فحص مجمعات Ptal-N * 01:01 / الببتيد من خلال مجموعة Crystal Screen I / II ومجموعة Index Screen و PEGIon kit I / II ومجموعة PEGRx (Hampton Research). تم تحضين الصفائح عند 291 كلفن و 277 كلفن وتم تقييمها لنمو البلورات بعد أسبوع إلى أسبوعين. لوحظت بلورات Ptal-N * 01:01 / HeV1 في 0.2 مولار كلوريد الصوديوم ، 0.1 مولار ثنائي تريس (درجة الحموضة 5.5) ، و 25٪ (وزن / حجم) بولي إيثيلين جلايكول 3350 بتركيز 7.5 مجم / مل. Ptal-N * 01:01 / HeV1 (الإنسان β2م) لوحظت البلورات في 0.1 مولار HEPES ، ودرجة الحموضة 7.0 ، و 2٪ وزن / وزن بولي إيثيلين جلايكول 3350. مونومر بات β2m في 0.1 M BIS-TRIS ، ودرجة الحموضة 6.5 ، و 8٪ وزن / وزن بولي إيثيلين جلايكول مونوميثيل إيثر 5000. نمت بلورات مفردة من Ptal-N * 01:01 / HeV2 في 0.075 M HEPES (درجة الحموضة 7.5) ، و 15٪ (وزن / حجم) بولي إيثيلين جلايكول 10000 ، و 25٪ (حجم / حجم) جلسرين بتركيز بروتين 10 مجم / مل. نمت بلورات مفردة من Ptal-N * 01:01 / EBOV-NP1 في 0.1 مولار من حمض السكسينيك (درجة الحموضة 7.0) و 15 ٪ (وزن / حجم) بولي إيثيلين جلايكول 3350. نمت بلورات مفردة من Ptal-N * 01:01 / EBOV-NP2 في 0.2 مولار من أسيتات الأمونيوم ، و 0.1 مولار تريس (درجة الحموضة 8.0) ، و 16 ٪ (وزن / حجم) بولي إيثيلين جلايكول 10000. نمت بلورات مفردة من Ptal-N * 01:01 (-3aa) / HeV1 في 0.2 مولار من فورمات الصوديوم و 20٪ (وزن / حجم) بولي إيثيلين جلايكول 3350. نمت بلورات مفردة من Ptal-N * 01:01 / H17N10-NP في 0.075 م HEPES (درجة الحموضة 7.5) ، و 15 ٪ (وزن / حجم) بولي إيثيلين جلايكول 10000 ، و 25 ٪ (ت / ت) جلسرين. نمت بلورات مفردة من Ptal-N * 01:01 / MERS-CoV-S3 في 0.2 M ثلاثي أسيتات الصوديوم و 20 ٪ (وزن / حجم) بولي إيثيلين جلايكول 3350. للحماية بالتبريد ، تم نقل البلورات إلى محاليل مكمن تحتوي على 20 ٪ من الجلسرين ثم تبريدها بفلاش في تيار من النيتروجين الغازي عند 100 K. تم جمع بيانات حيود الأشعة السينية في خط الأشعة BL19U من مرفق شنغهاي للإشعاع السنكروتروني. يتم عرض إحصاءات جمع البيانات في الجدول 1.

تحديد الهيكل والتحليلات

تمت معالجة الكثافة المجمعة لاحقًا وتوسيع نطاقها باستخدام برنامج Denzo وحزمة برامج HKL2000 (HKL Research). تم تحديد الهياكل باستخدام الاستبدال الجزيئي مع برنامج Phaser MR في CCP4 [56]. كان النموذج المستخدم هو تنسيق البنية مع كود بنك بيانات البروتين (PDB) 5F1I [35] ، وتم إجراء صقل مقيد باستخدام REFMAC5 من CCP4. تم تنفيذ بناء نموذج واسع النطاق يدويًا باستخدام COOT [57]. تم تقييم الجودة الكيميائية الفراغية للنموذج النهائي باستخدام برنامج REFINE في Phenix أو CCP4 (الجدول 1). تم إنشاء الأرقام المتعلقة بالهيكل باستخدام PyMOL (//www.pymol.org/) و COOT.

تحديد الثبات الحراري للبروتين باستخدام التحليل الطيفي للقرص المضغوط

تم اختبار الثبات الحراري لـ Ptal-N * 01:01 مع مجموعتين من الببتيدات الرئيسية للمجموعة بواسطة التحليل الطيفي للقرص المضغوط. تم إعادة طوى جميع المجمعات وتنقيتها وقياسها عند 0.2 مجم / مل في محلول 20 ملي مولار تريس (الرقم الهيدروجيني 8) و 50 ملي مول كلوريد الصوديوم. تم قياس أطياف القرص المضغوط عند 218 نانومتر على مطياف Chirascan (الفيزياء الضوئية التطبيقية) باستخدام كفيت متحكم فيه حراريًا على فترات درجة حرارة 0.2 درجة مئوية بمعدل تصاعدي قدره 1 درجة مئوية / دقيقة بين 20 و 90 درجة مئوية. يتم التعبير عن الكسر غير المطوي (٪) كـ (θ − θأ) / (θأ−θب) حيث θأ و θب هي قيم إهليلجيه البقايا المتوسطة في الحالات المطوية بالكامل وغير المطوية بالكامل ، على التوالي. تم إنشاء منحنيات التمسخ عن طريق الملاءمة غير الخطية مع OriginPro 8.0 (OriginLab) [58]. ال تيم تم حسابه عن طريق ملاءمة البيانات لمنحنيات التمسخ واستخدام المشتقات المحددة للانعطاف.


استشهد بهذا

  • APA
  • مؤلف
  • BIBTEX
  • هارفارد
  • اساسي
  • RIS
  • فانكوفر

في: علم الأحياء الحسابي PLoS ، المجلد. 16 ، رقم 5 ، e1007757 ، 26.05.2020.

مخرجات البحث: المساهمة في المجلة ›المقال› البحث ›مراجعة الأقران

T1 - تنبؤات المقارنة المعيارية لفئة معقد التوافق النسيجي الكبير I المقيدة بحلقات الخلايا التائية المقيدة في نظام نموذج مدروس بشكل شامل

عادةً ما يتم تحديد مرشحي حاتمة الخلايا N2 - T باستخدام أدوات التنبؤ الحسابية من أجل تمكين التطبيقات مثل تصميم اللقاح وتحديد المستضد الجديد للسرطان وتطوير التشخيص وإزالة الاستجابات المناعية غير المرغوب فيها ضد علاجات البروتين. تعتمد معظم أدوات التنبؤ بحلقة الخلايا التائية على خوارزميات التعلم الآلي المدربة على ربط معقد التوافق النسيجي الكبير أو بيانات شطف ارتباط معقد التوافق النسيجي الكبير التي تتم معالجتها بشكل طبيعي. لم يتم تقييم قدرة الأدوات المتاحة حاليًا على التنبؤ بحلقات الخلايا التائية بشكل شامل. في هذه الدراسة ، استخدمنا مجموعة بيانات منشورة مؤخرًا حددت بشكل منهجي حواتم الخلايا التائية المعترف بها في الفئران C57BL / 6 المصابة بفيروس اللقاح (VACV) (معبرة عن H-2Db و H-2Kb) ، مع الأخذ في الاعتبار كلا الببتيدات المتوقع ربطهما بـ MHC أو التصفية التجريبية من الخلايا المصابة ، مما يجعل هذه المجموعة الأكثر شمولاً من حواتم الخلايا التائية المعينة في مسببات الأمراض المعقدة. قمنا بتقييم أداء جميع أدوات التنبؤ بحلقة الخلايا التائية الحسابية المتاحة للجمهور لتحديد هذه الحلقات الرئيسية من جميع الببتيدات المشفرة في بروتين VACV. وجدنا أن جميع الطرق كانت قادرة على تحسين تحديد الحاتمة فوق العشوائية ، مع أفضل أداء تم تحقيقه من خلال التنبؤات المستندة إلى الشبكة العصبية المدربة على كل من بيانات ربط MHC و MHC lution (NetMHCPan-4.0 و MHCFlurry). بشكل مثير للإعجاب ، كانت هذه الطرق قادرة على التقاط أكثر من نصف الحلقات الرئيسية في أعلى تنبؤات N = 277 ضمن التنبؤات N = 767،788 التي تم إجراؤها للببتيدات المتميزة ذات الأطوال ذات الصلة والتي يمكن ترميزها نظريًا في بروتين VACV. توفر مقاييس الأداء هذه إرشادات لعلماء المناعة بشأن طرق التنبؤ التي يجب استخدامها ، ومعدلات النجاح الممكنة لتنبؤات الحاتمة عند التفكير في نظام شديد التحكم للتحصينات المعطاة للفئران الفطرية. بالإضافة إلى ذلك ، تم تنفيذ هذا المعيار بتنسيق مفتوح وسهل إعادة الإنتاج ، مما يوفر للمطورين إطارًا للمقارنات المستقبلية مقابل الأدوات الجديدة.

عادةً ما يتم تحديد المرشحين الحاتمي للخلايا AB-T باستخدام أدوات التنبؤ الحسابية من أجل تمكين التطبيقات مثل تصميم اللقاح وتحديد المستضد الجديد للسرطان وتطوير التشخيص وإزالة الاستجابات المناعية غير المرغوب فيها ضد علاجات البروتين. تعتمد معظم أدوات التنبؤ بحلقة الخلايا التائية على خوارزميات التعلم الآلي المدربة على ربط معقد التوافق النسيجي الكبير أو بيانات شطف ارتباط معقد التوافق النسيجي الكبير التي تتم معالجتها بشكل طبيعي. لم يتم تقييم قدرة الأدوات المتاحة حاليًا على التنبؤ بحلقات الخلايا التائية بشكل شامل. في هذه الدراسة ، استخدمنا مجموعة بيانات منشورة مؤخرًا حددت بشكل منهجي حواتم الخلايا التائية المعترف بها في الفئران C57BL / 6 المصابة بفيروس اللقاح (VACV) (معبرة عن H-2Db و H-2Kb) ، مع الأخذ في الاعتبار كلا الببتيدات المتوقع ربطهما بـ MHC أو التصفية التجريبية من الخلايا المصابة ، مما يجعل هذه المجموعة الأكثر شمولاً من حواتم الخلايا التائية المعينة في مسببات الأمراض المعقدة. قمنا بتقييم أداء جميع أدوات التنبؤ بحلقة الخلايا التائية الحسابية المتاحة للجمهور لتحديد هذه الحلقات الرئيسية من جميع الببتيدات المشفرة في بروتين VACV. وجدنا أن جميع الطرق كانت قادرة على تحسين تحديد الحاتمة فوق العشوائية ، مع أفضل أداء تم تحقيقه من خلال التنبؤات المستندة إلى الشبكة العصبية المدربة على بيانات ربط MHC و MHC lution (NetMHCPan-4.0 و MHCFlurry). بشكل مثير للإعجاب ، كانت هذه الطرق قادرة على التقاط أكثر من نصف الحلقات الرئيسية في أعلى تنبؤات N = 277 ضمن التنبؤات N = 767،788 التي تم إجراؤها للببتيدات المتميزة ذات الأطوال ذات الصلة والتي يمكن ترميزها نظريًا في بروتين VACV. توفر مقاييس الأداء هذه إرشادات لعلماء المناعة بشأن طرق التنبؤ التي يجب استخدامها ، ومعدلات النجاح الممكنة لتنبؤات الحاتمة عند التفكير في نظام شديد التحكم للتحصينات المعطاة للفئران الفطرية. بالإضافة إلى ذلك ، تم تنفيذ هذا المعيار في تنسيق مفتوح وسهل إعادة الإنتاج ، مما يوفر للمطورين إطارًا للمقارنات المستقبلية مقابل الأدوات الجديدة.


روابط MHC وزخارف الببتيد: القائمة الأولى

Achour، A.، Picard، O.، Zagury، D.، Sarin، PS، Gallo، RC، Nagler، PH، and Goldstein، AL HGP-30 ، التناظرية الاصطناعية لفيروس نقص المناعة البشرية (HIV) (ص 17) ، هو هدف للخلايا اللمفاوية التائية السامة للخلايا في الأفراد المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية. Proc Natl Acad Sci USA 87: 7045–7049, 1990

Alsheiklhy، A.R. تفاعل الخلايا التائية السامة للخلايا المتولدة في المختبر وفي الجسم الحي مع مستضد SV40 T - التحليل مع الببتيدات الاصطناعية. سكاند جي إمونول 39: 467–479, 1994

Altuvia، Y.، Berzofsky، J.A، Rosenfeld، R.، and Margalit، H. Sequence سمات مرتبطة بتقييد MHC. مول إمونول 31: 1–19, 1994

أندرسون ، دي سي ، فان شوتين ، دبليو سي إيه ، باري ، إم إي ، جانسون ، إيه إيه إم ، بوكانان ، تي إم ، ودي فريس ، آر آر بي ، حاتمة الخلايا التائية البشرية الخاصة بالمتفطرة الجذامية المتفاعلة مع ببتيد HLA-DR2. العلوم 242: 259, 1988

البنوك ، T. A. ، Nair ، S. ، and Rouse ، B. T. ياء فيرول 67: 613–616, 1993

Bastin، J.، Rothbard، J.، Davey، J.، Jones، I.، and Townsend، A. J Exp Med 165: 1508–1523, 1987

Beauverger ، P. ، Buckland ، R. ، and Wild ، T. F. تحفز مستضدات فيروس الحصبة كلاً من النوع المحدد وفيروس السل الكلابي المتصالب عبر تفاعل الخلايا اللمفاوية التائية السامة للخلايا في الفئران: توطين حاتمة بروتين نووي مقيد من النوع L d. جي جين فيرول 74: 2357–2363, 1993

Beauverger، P.، Buckland، R.، and Wild، F. يستحث هيماجلوتينين الحصبة L d- مقيد CD8 + الخلايا الليمفاوية التائية السامة للخلايا لاثنين من حواتم محددة. علم الفيروسات 200: 281–283, 1994

Bednarek ، M.A ، Sauma ، S. Y. ، Gammon ، M.C ، Porter ، G. ، Tamhankar ، S. ، Williamson ، A.R ، and Zweerink ، H. J. الحد الأدنى من حاتمة الببتيد من بروتين مصفوفة الأنفلونزا. التحميل الإضافي وداخل الخلايا لـ HLA-A2. J إمونول 147: 4047–4053, 1991

Bergmann ، C. ، McMillan ، M. ، and Stohlman ، S. توصيف حاتمة الخلايا اللمفاوية التائية المقيدة للخلايا L d في بروتين نوكليوكابسيد فيروس التهاب الكبد الفيروسي. ياء فيرول 67: 7041-7049، 1993 أ

Bergmann ، C. ، Stohlmann ، S. A. ، and McMillan ، M. إن الببتيد المُحلل المُصنَّع داخليًا يجهز بكفاءة الخلايا التائية السامة للخلايا الخاصة بالبروتين السكري لمغلف HIV-1. Eur J إمونول 23: 2777-2781، 1993b

Bertoletti، A.، Chisari، FV، Penna، A.، Guilhot، S.، Galati، L.، Missale، G.، Fowler، P.، Schlicht، HJ، Vitiello، A.، Chesnut، RC، Fiaccadori، F . ، و Ferrari ، C. تعريف الحد الأدنى من حاتمة الخلايا التائية السامة للخلايا المثلى داخل بروتين nucleocapsid لفيروس التهاب الكبد B. ياء فيرول 67: 2376–2380, 1993

Bertoletti، A.، Costanzo، A.، Chisari، FV، Levrero، M.، Artini، M.، Sette، A.، Penna، A.، Giuberti، T.، Fiaccadori، F.، and Ferrari، C. Cytotoxic استجابة الخلايا اللمفاوية التائية إلى حاتمة فيروس التهاب الكبد B من النوع البري في المرضى المصابين بشكل مزمن بالفيروسات المتغيرة التي تحمل البدائل داخل الحاتمة. J Exp Med 180: 933–943, 1994

Blum-Tirouvanziam، U.، Beghdadi-Rais، C.، Roggero، MA، Valmori، D.، Bertholet، S.، Bron، C.، Fasel، N.، and Corradin، G. التحصين مع عديد الببتيدات الاصطناعية القابلة للذوبان في الملاريا. J إمونول 153: 4134–4141, 1994

بودمر ، جي جي ، مارش ، إس جي ، ألبرت ، إد ، بودمر ، دبليو إف ، دوبونت ، بي ، إيرليش ، ها ، ماخ ، بي ، ماير ، دبليو آر ، بارهام ، بي ، ساسازوكي ، تي ، شرودر ، جي إم تي ، سترومينجر ، JL، Svejgaard، A.، and Terasaki، PI Nomenclature لعوامل نظام HLA ، 1994. مستضدات الأنسجة 44: 1–18, 1994

Bogen، B.، Snodgrass، R.، Briand، J.P، and Hannestad، K. تكشف الببتيدات الاصطناعية وإعادة ترتيب الجينات في سلسلة بيتا عن ذخيرة متنوعة من الخلايا التائية لسلسلة لامدا الخفيفة المنطقة الثالثة شديدة التغير. Eur J Immmunol 16: 1379–1384, 1986

Bonneau، R.H، Salvucci، L.A، Johnson، D.C، and Tevethia، S. S.خصوصية حاتمة استنساخ الخلايا اللمفاوية التائية السامة للخلايا H-2Kb المقيدة ، HSV-1 عبر رد الفعل. علم الفيروسات 195: 62–70, 1993

براسيال ، T. J. ، Braciale ، V. L. ، Winkler ، M. ، Stroynowski ، I. ، Hood ، L. ، Sambrook ، J. ، and Gething ، M.-J. حول دور تسلسل المرساة عبر الغشاء من هيماجلوتينين الإنفلونزا في التعرف على الخلايا المستهدفة من خلال الخلايا الليمفاوية التائية الخلوية التائية الخاصة بالهيماجلوتينين المقيدة بالفئة الأولى من معقد التوافق النسيجي الكبير. J Exp Med 166: 678–692, 1987

Brichard، V.، Van Pel، A.، Wölfel، T.، Wölfel، C.، De Plaen، E.، Lethe، B.، Coulie، P.، and Boon، T. بواسطة الخلايا اللمفاوية التائية الحالة للخلايا الذاتية على الأورام الميلانينية HLA-A2. J Exp Med 178: 489–495, 1993

بروكس ، جي إم ، موراي ، آر جيه ، توماس ، دبليو إيه ، كوريلا ، إم جي ، وريكنسون ، إيه بي ، أنواع فرعية مختلفة من HLA-B27 تقدم نفس الببتيد المناعي لفيروس إبشتاين بار. J Exp Med 178: 879–887, 1993

Brown، EL، Wooters، JL، Ferenz، CR، O'Brien، CM، Hewick، RM، and Herrmann، SH توصيف ارتباط الببتيد بجزيء MHC من الفئة I H-2K k - تسلسل الببتيدات المرتبطة والربط المباشر من الببتيدات الاصطناعية لجزيئات الفئة الأولى المعزولة. J إمونول 153: 3079–3092, 1994

براون ، جيه إتش ، جارديتزكي ، تي إس ، جورجا ، جي سي ، ستيرن ، L. طبيعة 364: 33–39, 1993

بوروز ، S. R. ، Sculley ، T. B. ، Misko ، I. S. ، Schmidt ، C. ، and Moss ، D. J. J Exp Med 171: 345–349, 1990

Buseyne ، F. ، McChesney ، M. ، Porrot ، F. ، Kovarik ، S. ، Guy ، B. ، and Riviere ، Y. تتجمع حواتم الكمامة في ثلاث مناطق من بروتين p24gag. ياء فيرول 67: 694–702, 1993

Buseyne، F. and Riviere، Y. HIV الخاص بـ CD8 + T-cell immunses reponses والتكاثر الفيروسي. الإيدز 7: S81-S85 ، 1993

Buus، S.، Sette، A.، Colon، S. M.، Miles، C.، and Gray، H. M. العلاقة بين التوافق النسيجي الرئيسي يقيد (MHC) وقدرة Ia على ربط الببتيدات المناعية. العلوم 235: 1353–1358, 1987

Cao، W. X.، Myers-Powell، B. A.، and Braciale، T.J. J Exp Med 179: 195–202, 1994

كاربون ، F. R. ، مور ، M.W ، شيل ، J.M ، و Bevan ، M. J. تحريض الخلايا الليمفاوية التائية السامة للخلايا عن طريق التحفيز الأولي في المختبر مع الببتيدات. J Exp Med 167: 1767–1779, 1988

Celis، E.، Tsai، V.، Crimi، C.، DeMars، R.، Wentworth، PA، Chesnut، RW، Gray، HM، Sette، A.، and Serra، HM Induction of antitumor cytotoxic T-lymphocytes in normal البشر الذين يستخدمون الثقافات الأولية وحلقات الببتيد الاصطناعية. Proc Natl Acad Sci USA 91: 2105–2109, 1994

Cerrone ، M.C ، Ma ، J. J. ، and Stephens ، R. S. الاستنساخ وتسلسل الجين الخاص ببروتين الصدمة الحرارية -60 من المتدثرة الحثرية والتفاعل المناعي للبروتين. تصيب المناعة 59: 79–90, 1991

Cerundo ، V. ، Elliot ، T. ، Elvin ، J. ، Bastin ، J. ، Rammensee ، H.-G. ، and Townsend ، A. معدلات تقارب الارتباط وتفكك الببتيدات للفئة الأولى من الجزيئات المعقدة للتوافق النسيجي. Eur J إمونول 21: 2069–2075, 1991

Chicz، R.M، Urban، R.G، Lane، W.S، Gorga، J.C، Stern، L.J، Vignali، D.AA، and Strominger، J.L. طبيعة 358: 764–768, 1992

Chicz، R.M، Urban، R.G، Gorga، J.C، Vigali، D.A A.، Lane، W. S.، and Strominger، J.L. HLA-DR الأليلات. J Exp Med 178: 27–47, 1993

Corr ، M. ، Boyd ، LF ، Frankel ، SR ، Kozlowski ، S. ، Padlan ، EA ، and Margulies ، DH الببتيدات الذاتية لجزيء من الدرجة الأولى معقد قابل للذوبان في التوافق النسيجي كبير قابل للذوبان ، H-2L d s- تسلسل الفكرة ، الربط الكمي ، والنمذجة الجزيئية للمركب. J Exp Med 176: 1681–1692, 1992

Corr ، M. ، Boyd ، L.F ، Padlan ، E.A ، and Margulies ، D.H-2D d يستغل 4 أشكال ربط الببتيد المتبقية. J Exp Med 178: 1877–1892, 1993

Cossins و J. و Gould و KG و Smith و M. و Driscoll و P. عنصر. علم الفيروسات 193: 289–295, 1993

Coulie، PG، Brichard، V.، Van Pel، A.، Wölel، T.، Schneider، J.، Traversari، C.، Mattei، S.، De Plaen، E.، Lurquin، C.، Szikora، JP، Renauld، JC، and Boon، T. ترميز جيني جديد لمستضد التمايز المعترف به بواسطة الخلايا اللمفاوية التائية المحللة للخلايا الذاتية على الأورام الميلانينية HLA-A2. J Exp Med 180: 35–42, 1994

Cox، AL، Skipper، J.، Chen، Y.، Henderson، RA، Darrow، TL، Shabanowitz، J.، Engelhard، VH، Hunt، DF، and Slingluff، CL خطوط الخلايا التائية السامة للخلايا. العلوم 264: 716–719, 1994

كريسويل ، P. تجميع ونقل ووظيفة جزيئات معقد التوافق النسيجي الكبير من الفئة الثانية. Annu Rev Immunol 12: 259–293, 1994

Culmann ، B. ، Gomard ، E. ، Kieny ، MP ، Guy ، B. ، Dreyfus ، F. ، Saimot ، AG ، Sereni ، D. ، Sicard ، D. ، and Levy ، JP 6 حواتم تتفاعل مع CD8 السامة للخلايا البشرية الخلايا التائية في المنطقة الوسطى من بروتين HIV-1 nef. J إمونول 146: 1560–1565, 1991

Dai، LC، West، K.، Littaua، R.، Takahashi، K.، and Ennis، FA طفرة نوع فيروس نقص المناعة البشرية من النوع 1 في الأحماض الأمينية 585 على gp41 يؤدي إلى فقدان القتل بواسطة الخلايا الليمفاوية التائية المقيدة CD8 + A24. . ياء فيرول 66: 3151–3154, 1992

De Bergeyck ، V. ، De Plaen ، E. ، Chomez ، P. ، Boon ، T. ، and Van Pel ، A. أكواد تسلسل داخل الجسيمات A لمولد مضاد تم التعرف عليه بواسطة الخلايا اللمفاوية التائية الحالة للخلايا المصاحبة على ابيضاض الدم العفوي في الفأر. Eur J Immunol 24: 2203–2212, 1994

Deckhut، A. M.، Lippolis، J.D، and Tevethia، S. S. ياء فيرول 66: 440–447, 1992

DiBrino، M.، Parker، KC، Shiloach، J.، Knierman، M.، Lukszo، J.، Turner، RV، Biddison، WE، and Coligan، JE Endogenous peptides المرتبطة بـ HLA-A3 تمتلك مجموعة محددة من بقايا المرساة التي تسمح بتحديد الببتيدات المستضدية المحتملة. Proc Natl Acad Sci USA 90: 1508-1512 ، 1993 أ

DiBrino، M.، Tsuchida، T.، Turner، R.V، Parker، K.C، Coligan، J.E، and Biddison، W.E HLA-A1 and HLA-A3 T-cell epitopes المشتقة من بروتينات فيروس الأنفلونزا المتوقعة من أشكال ربط الببتيد. J إمونول 151: 5930-5935، 1993b

DiBrino، M.، Parker، KC، Shiloach، J.، Turner، RV، Tsuchida، T.، Garfield، M.، Baddison، WE، and Coligan، JE Endogenous peptides with premium amino acid anchor المتبقية أشكال مرتبطة بـ HLA-A1 و HLA-B8. J إمونول 152: 620–631, 1994

ديك ، إل آر ، ألدريتش ، سي ، جيمسون ، إس سي ، موماو ، سي آر ، برامانيك ، كولومبيا البريطانية ، دويل ، سي كيه ، ديمارتينو ، جي إن ، بيفان ، إم جي ، فورمان ، جي إم ، وسلوتر ، كاليفورنيا المعالجة المحللة للبروتين للأبيض والبيتا- galactosidase بواسطة البروتياز لإنتاج الببتيدات المستضدية. J إمونول 152: 3884–3894, 1994

Eberl ، G. ، Sabbatini ، A. ، Servis ، C. ، Romero ، P. ، Maryanski ، J.L ، and Corradin ، G. MHC class I H-2K d- الببتيدات المستضدية المقيدة: قيود إضافية لعنصر الربط. Int إمونول 5: 1489–1492, 1993

Engelhard، VH، Appella، E.، Benjamin، DC، Bodnar، WM، Cox، AL، Chen، Y.، Henderson، RA، Huczko، EL، Michel، H.، Sakaguichi، K.، Shabanowitz، J.، Sevilir و N. و Slingluff و CL و Hunt و DF تحليل طيف الكتلة للببتيدات المرتبطة بجزيئات HLA-A2.1 و HLA-B7 البشرية من الدرجة الأولى وتحديد الميزات الهيكلية التي تحدد الارتباط. في أ. سيت (محرر): الببتيدات المصنعة طبيعيا، كارجر ، ص 39-62 ، 1993

Engelhard، V.H. بنية الببتيدات المرتبطة بجزيئات معقد التوافق النسيجي الكبير من الدرجة الأولى. أوبن بالعملة إمونول 6: 13–23, 1994

فالك ، ك. ، روتزشك ، أو. ، ورامينسي ، هـ. تكوين الببتيد الخلوي تحكمه جزيئات الدرجة الأولى المعقدة من التوافق النسيجي. طبيعة 348: 248–251, 1990

فالك ، ك. ، روتزشك ، أو. ، ديريس ، ك. ، ميتزجر ، ج. ، يونج ، ج. ، ورامينسي ، هـ. يسمح التعرف على غير الببتيدات الفيروسية المعالجة بشكل طبيعي بتحديدها الكمي في الخلايا المصابة وتقترح تنبؤات حاتمة الخلايا التائية الخاصة بالأليل. J Exp Med 174: 425-434، 1991 أ

فالك ، ك. ، روتزشك ، أو. ، ستيفانوفيتش ، إس. ، يونج ، جي ، ورامينسي ، هـ. تم الكشف عن الأشكال الخاصة بالأليل من خلال تسلسل الببتيدات الذاتية المستخرجة من جزيئات معقد التوافق النسيجي الكبير. الطبيعة 351: 290 - 296، 1991 ب

فالك ، ك. ، روتزشك ، أو. ، جراهوفاك ، ب ، شيندل ، د ، ستيفانوفيتش ، س ، جناو ، ف ، يونج ، ج ، سترومينجر ، جيه إل ، ورامينسي ، هـ- ج. أشكال يجند الببتيد الخاصة بأليل لجزيئات HLA-C. Proc Natl Acad Sci USA 90: 12005-12009 ، 1993 أ

فالك ، ك. ، روتزشك ، أو. ، جراهوفاك ، ب ، شيندل ، د ، ستيفانوفيتش ، س ، يونج ، ج ، ورامينسي ، هـ. الأشكال الببتيدية لجزيئات HLA-B35 و HLA-B37. علم الوراثة المناعية 38: 161–162، 1993b

Falk، K.، Rötzschke، O.، Stevanović، S.، Gnau، V.، Sparbier، K.، Jung، G.، Rammensee، H.-G، and Walden، P. تحليل فئة HLA تحدث بشكل طبيعي أنا مقيدة حاتمة الفيروسية. علم المناعة 82: 337–342، 1994 أ

فالك ، ك. ، روتزشك ، أو. ، ستيفانوفيتش ، إس. ، يونج ، جي ، ورامينسي ، هـ. يكشف تسلسل تجمع روابط HLA-DR و DQ و DP الطبيعية عن أشكال الببتيد التفصيلية وقيود المعالجة والقواعد العامة. علم الوراثة المناعية 39: 230 - 242، 1994 ب

فالك ، ك. ، روتزشك ، أو. ، تاكيجوتشي ، إم ، جراهوفاك ، ب ، جناو ، ف ، ستيفانوفيتش ، إس ، يونج ، جي ، ورامينسي ، إتش- جي. الأشكال الببتيدية لجزيئات HLA-A1 و -A11 و -A31 و -A33. علم الوراثة المناعية 40: 238-241، 1994 ج

فالك ، ك. ، روتزشكي ، أو. ، تاكيجوتشي ، إم ، جناو ، ف ، ستيفانوفيتش ، إس ، يونج ، جي ، ورامينسي ، إتش- جي. الأشكال الببتيدية لجزيئات HLA-B51 و -B52 و-B78 وتأثيرها على مرض بهجت. Int إمونول 7: 223 - 228، 1995 أ

فالك ، ك. ، روتزشكي ، أو. ، تاكيجوتشي ، إم ، جناو ، ف ، ستيفانوفيتش ، إس ، يونج ، جي ، ورامينسي ، إتش- جي. الأشكال الببتيدية لجزيئات HLA-B38 و B39. علم الوراثة المناعية 41: 162–164، 1995b

فالك ، ك. ، روتزشكي ، أو. ، تاكيجوتشي ، إم ، جناو ، ف ، ستيفانوفيتش ، إس ، يونج ، جي ، ورامينسي ، إتش- جي. الأشكال الببتيدية لجزيئات HLA-B58 و B60 و B61 و B62. علم الوراثة المناعية 41: 165–168، 1995c

Falk، K. and Rötzschke، O. زخارف إجماع وروابط الببتيد لجزيئات معقد التوافق النسيجي الكبير من الدرجة الأولى. سيم إمونول 5: 81–94, 1993

Feltkamp ، MCW ، Smith ، HL ، Vierboom ، MPM ، Minnaar ، RP ، Dejongh ، BM ، Drijfhout ، JW ، Terschegget ، J. ، Melief ، CJM ، و Kast ، تلقيح WM مع الببتيد السام للخلايا T-lymphocyte يحمي من a الورم الناجم عن فيروس الورم الحليمي البشري من النوع 16 الخلايا المتحولة. Eur J إمونول 23: 2242–2249, 1993

فيشر ليندال ، ك.ف ، هرمل ، إ. ، لوفلاند ، ب.إ. ، ووانج ، س.ر. مستضد الفئران المنتقل عن طريق الأم - مستضد زرع نموذجي. Annu Rev Immunol 9: 351–372, 1991

Fleischhauer ، K. ، Wallny ، H.-J. ، Avila ، D. ، Vilbois ، F. ، Traversari ، C. ، and Bordignon ، C. مستضدات الأنسجة، في الصحافة

Franco ، M.A ، Prieto ، I. ، Labbe ، M. ، Poncet ، D. ، Borras-Cuesta ، F. ، and Cohen ، J. جي جين فيرول 74: 2579–2586, 1993

Franco، M.A، Lefevre، P.، Willems، P.، Lintermanns، P.، Tosser، G.، and Cohen، J. تحديد حواتم الخلايا التائية السامة للخلايا على بروتينات فيروس الروتا Vp3 و Vp6. جي جين فيرول 75: 589–596, 1994

Fremont ، D.H ، Matsamura ، M. ، Stura ، E.A ، Peterson ، P. A. ، and Wilson ، I.A الهياكل البلورية لاثنين من الببتيدات الفيروسية في مركب مع الفئران MHC class I H-2K b. العلوم 257: 919–927, 1992

Frumento ، G. ، Harris ، P. E. ، Gawinowicz ، M.A ، Suciu-Foca ، N. ، and Pernis ، B. تسلسل ببتيد ذاتي بارز مكون من 16 بقايا مرتبط بـ HLA-B27 في خط الخلية اللمفاوية. خلية إمونول 152: 623–626, 1993

Gaugler، B.، Van den Eynde، B.، Van der Bruggen، P.، Romero، P.، Gaforio، JJ، De Plaen، E.، Lethe، B.، Brasseur، F.، and Boon، T. Human أكواد الجين MAGE-3 لمستضد تم التعرف عليه على الورم الميلانيني بواسطة الخلايا اللمفاوية التائية الحالة للخلايا الذاتية. J Exp Med 179: 921–930, 1994

Gavin ، M.A ، Gilbert ، M.J ، Riddell ، S.R ، Greenberg ، P. D. ، and Bevan ، M. J. يسمح التحلل المائي القلوي للبروتينات المؤتلفة بالتعرف السريع على حواتم CTL المقيدة من الفئة I MHC. J إمونول 151: 3971–3980, 1993

Gavioli ، R. ، Kurilla ، MG ، De Campos-Lima ، PO ، Wallace ، LE ، Dolcetti ، R. ، Murray ، RJ ، Rickinson ، AB ، and Masucci ، MG Multiple HLA A11 المقيدة للخلايا اللمفاوية التائية الحاتمات المناعية المختلفة في المستضد النووي المشفر بفيروس Epstein-Barr 4. ياء فيرول 67: 1572–1578, 1993

Geluk ، A. ، Van Meijgaarden ، KE ، Janson ، AAM ، Drijfhout ، JW ، Meloen ، RH ، De Vries ، RRP ، و Ottenhoff ، تحليل THM الوظيفي لـ DR17 (DR3) المقيدة للخلية التائية المتفطرة حاتمات تكشف عن نموذج ربط DR17 ويتيح تصميم الببتيدات المنافسة الخاصة بأليل. J إمونول 149: 2864–2871, 1992

Geluk و A. و Van Meijgaarden و KE و Southwood و S. و Oseroff و C. و Drijfhout و JW و De Vries و RRP و Ottenhoff و THM و Sette و A. . J إمونول 152: 5742–5748, 1994

Gotch ، F. ، McMichael ، A. ، and Rothbard ، J. التعرف على بروتين مصفوفة الأنفلونزا بواسطة الخلايا الليمفاوية التائية السامة للخلايا المقيدة HLA-A2. استخدام نظائرها لتوجيه ببتيد المصفوفة في موقع ربط HLA-A2. J Exp Med 168: 2045–2057, 1988

Gould ، K. ، Cossins ، J. ، Bastin ، J. ، Brownlee ، G.G ، and Townsend ، A. يتم تقديم جزء من الحمض الأميني 15 من بروتين نووي الإنفلونزا المركب في السيتوبلازم إلى الخلايا الليمفاوية التائية المقيدة للخلايا من الفئة الأولى. J Exp Med 170: 1051–1056, 1989

Gould و KG و Scotney و H. و Townsend و AR و Bastin و J. / 34 هيماجلوتينين. J Exp Med 166: 693–701, 1987

Gould ، K.G ، Scotney ، H. ، and Brownlee ، G.G. توصيف اثنين من معقدات التوافق النسيجي الرئيسية المتميزة من الفئة I K k- حواتم الخلايا التائية المقيدة داخل هيماجلوتينين فيروس الأنفلونزا A / PR / 8/34. ياء فيرول 65: 5401–5409, 1991

Gregersen ، P. K. ، Silver ، J. ، and Winchester ، R.J. فرضية الحاتمة المشتركة. نهج لفهم علم الوراثة الجزيئي من القابلية للإصابة بالتهاب المفاصل الروماتويدي. التهاب المفاصل الرومات 30: 1205–1213, 1987

Guo ، H. C. ، Jardetzky ، T. S. ، Garrett ، T.P.J ، Lane ، W.S ، Strominger ، J.L ، and Wiley ، D.C. طبيعة 360: 364–366, 1992

Guo، HC، Madden، DR، Silver، ML، Jardetzky، TS، Gorga، JC، Strominger، JL، and Wiley، DC مقارنة جيب خصوصية P2 في ثلاثة مولدات مضادة للتوافق النسيجي البشري - HLA-A * 6801، HLA-A * 0201 و HLA-B * 2705. Proc Natl Acad Sci USA 90: 8053–8057, 1993

Hammer، J.، Takacs، B.، and Sinigaglia، F. تحديد الحافز لببتيدات ربط HLA-DR1 باستخدام مكتبات العرض M13. J Exp Med 176: 1007–1013, 1992

Hammer، J.، Valsasnini، P.، Tolba، K.، Bolin، D.، Higelin، J.، Takacs، B.، and Sinigaglia، F. Promiscuos and allele-specific anchors in HLA-DR-beptides. الخلية 74: 197–203, 1993

Hammer ، J. ، Bono ، E. ، Gallazzi ، F. ، Belunis ، C. ، Nagy ، Z. ، and Sinigaglia ، F. J Exp Med 180: 2353–2358, 1994

Harpur، A. G.، Ziemiekci، A.، Wilks، A.F، Falk، K.، Rötzschke، O.، and Rammensee، H.-G. يُشتق مركب H-2K d ligand الطبيعي البارز من بروتين-التيروزين كيناز JAK1. إمونول ليت 35: 235–238, 1993

Harris ، P. E. ، Colovai ، A. ، Liu ، Z. ، Favera ، R.D ، and Suciu-Foca ، N. المجهزة بشكل طبيعي من فئة HLA الأولى المرتبطة بالببتيدات من الخلايا المصابة بالعدوى الفطرية c-myc تكشف عن الزخارف الخاصة بالأليل. J إمونول 151: 5966–5974, 1993

Henderson ، RA ، Michel ، H. ، Sakaguchi ، K. ، Shabanowitz ، J. ، Appella ، E. ، Hunt ، DF ، and Engelhard ، VH HLA-A2.1-related peptides from a mutant cell line - a second pathway of عرض مستضد. العلوم 255: 1264–1266, 1992

Henderson، RA، Cox، AL، Sakaguchi، K.، Appella، E.، Shabanowitz، J.، Hunt، DF، and Engelhard، VH التحديد المباشر للببتيد الداخلي المعترف به بواسطة العديد من الخلايا التائية السامة للخلايا الخاصة بـ HLA-A2.1 . Proc Natl Acad Sci USA 90: 10275–10279, 1993

Hill، AVS، Elvin، J.، Willis، AC، Aidoo، M.، Allsopp، CEM، Gotch، FM، Gao، XM، Takiguchi، M.، Greenwood، BM، Townsend، ARM، McMichael، AJ، and Whittle ، التحليل الجزيئي لاتحاد HLA-B53 ومقاومة الملاريا الشديدة. طبيعة 360: 434–439, 1992

Hill و CM و Liu و A. و Marshall و KW و Mayer و J. و Jorgensen و B. و Yuan و B. و Cubbon و RM و Nichols و EA و Wicker و LS و Rothbard و JB Exploration للمتطلبات الخاصة بربط الببتيد إلى HLA DRB1 * 0101 و DRB1 * 0401. J إمونول 152: 2890–2898 1994

Hosmalin، A.، Clerici، M.، Houghten، R.، Pendleton، CD، Felxner، C.، Lucey، DR، Moss، B.، Germain، RN، Shearer، GM، and Berzofsky، JA An epitope in Human immunodeficiency فيروس 1 النسخ العكسي للفيروس المعترف به من قبل كل من الفئران والخلايا اللمفاوية التائية السامة للخلايا البشرية. Proc Natl Acad Sci USA 87: 2344–2348, 1990

Howard، J.C and Seelig، A. Antigen-Processing - peptides and the proteasome. طبيعة 365: 211–212, 1993

Huczko، EL، Bodnar، WM، Benjamin، D.، Sakaguchi، K.، Zhu، NZ، Shabanowitz، J.، Henderson، RA، Appella، E.، Hunt، DF، and Engelhard، VH يتم تحديد جزيء HLA-B7 من الفئة I بواسطة مطياف الكتلة ونمذجة الكمبيوتر. J إمونول 151: 2572–2587, 1993

Huet، S.، Nixon، D.F، Rothbard، J.B، Townsend، A.، Ellis، S.A، and McMichael، A.J.تشير التماثلات الهيكلية بين اثنين من الببتيدات المقيدة بـ HLA B27 إلى وجود بقايا مهمة للتفاعل مع HLA B27. Int إمونول 2: 311–316, 1990

Hunt و DF و Henderson و RA و Shabanowitz و J. و Sakaguchi و K. و Michel و H. و Sevilir و N. و Cox و AL و Appella و E. و Engelhard و VH توصيف الببتيدات المرتبطة بالفئة I MHC جزيء HLA-A2.1 بواسطة مطياف الكتلة. العلوم 255: ١٢٦١-١٢٦٣ ، ١٩٩٢ أ

Hunt و DF و Michel و H. و Dickinson و TA و Shabanowitz و J. و Cox و AL و Sakaguchi و K. و Appella و E. و Gray و HM و Sette و A. من الدرجة الثانية جزيء معقد التوافق النسيجي الرئيسي IA د. العلوم 256: 1817-1820 ، 1992 ب

جاكسون ، إم آر ، كوهيندويل ، إم إف ، بيترسون ، بي إيه ، وويليامز ، دي بي. تنظيم نقل معقد التوافق النسيجي الكبير من الدرجة الأولى بواسطة المرافق الجزيئي ، كالنيكسين (P88 ، IP90). العلوم 263: 384–387, 1994

جاكسون ، إم آر وبيترسون ، بي.أ.التجميع والنقل داخل الخلايا لجزيئات معقد التوافق النسيجي الكبير من الدرجة الأولى. Annu Rev Cell Biol 9: 207–235, 1993

Jardetzky ، T. S. ، Lane ، W. S. ، Robinson ، R.A ، Madden ، D.R ، and Wiley ، D.C. تحديد الببتيدات الذاتية المرتبطة بـ HLA-B المنقى. الطبيعة 353: 326–329, 1991

جونسون ، آر بي ، تروشا ، إيه ، بوكانان ، تي إم ، ووكر ، بي دي التعرف على منطقة محمية للغاية من فيروس نقص المناعة البشرية من النوع 1 gp 120 بواسطة استنساخ الخلايا اللمفاوية التائية السامة للخلايا HLA-Cw4. ياء فيرول 67: 438–445, 1993

جويس ، إس ، تاباتشوسكي ، بي ، أنجيليتي ، آر إتش ، ناثنسون ، إس جي ، وستروينوفسكي ، آي. جزيء معقد التوافق النسيجي الرئيسي غير متعدد الأشكال من الفئة الأولى ب يربط مجموعة كبيرة من الببتيدات الذاتية المتنوعة. J Exp Med 179: 579–588, 1994

كاست ، دبليو إم ، أورينجا ، آر ، بيترز ، بي جيه ، فورورو ، إيه سي ، ميلوين ، آر إتش ، فان دير إب ، إيه جيه ، وميليف ، سي جي إم.استئصال الأورام المستحثة بالفيروس الغدي E1 بواسطة الخلايا الليمفاوية التائية السامة للخلايا E1A. الخلية 59: 603–614, 1989

Kast و WM و Roux و L. و Curren و L. و Blom و HJJ و Voordouw و AC و Meloen و RH و Kolakofsky و D. الخلايا الليمفاوية التائية مع الببتيد الاصطناعي الحر Proc Natl Acad Sci USA 88: 2283–2287, 1991

Kast و WM و Brandt و RMP و Sidney و J. و Drijfhout و JW و Kubo و RT و Gray و HM و Melief و CJM و Sette و A. دور أشكال HLA-A في تحديد حلقات CTL المحتملة في نوع فيروس الورم الحليمي البشري 16 بروتين E6 و E7. J إمونول 152: 3904–3912, 1994

Kawakami، Y.، Eliyahu، S.، Delgado، CH، Robbins، PF، Rivoltini، L.، Topalian، SL، Miki، T. تسلل الخلايا التائية الذاتية إلى الورم. Proc Natl Acad Sci USA 91: 3515–3519، 1994 أ

Kawakami ، Y. ، Eliyahu ، S. ، Delgado ، CH ، Robbins ، PF ، Sakaguchi ، K. ، Appella ، E. ، Yannelli ، JR ، Adema ، GJ ، Miki ، T. ، and Rosenberg ، SA تحديد الإنسان- مستضد سرطان الجلد المعترف به عن طريق الخلايا الليمفاوية المتسللة إلى الورم المرتبطة برفض الورم في الجسم الحي. Proc Natl Acad Sci USA 91: 6458–6462، 1994b

Kawakami، Y.، Eliyahu، S.، Sakaguchi، K.، Robbins، PF، Rivoltini، L.، Yannelli، JR، Appella، E.، and Rosenberg، SA تحديد الببتيدات المناعية المناعية لمستضد سرطان الجلد البشري MART-1 معترف بها من قبل غالبية الخلايا الليمفاوية التي تتسلل إلى الورم المقيد HLA-A2. J Exp Med 180: 347–352، 1994 ج

خليل ، أ. ، دوريول ، إل ، غوبيت ، إم ، مورين ، إل. ، ليباج ، ف ، ديشامب ، آي ، بارك ، إم إس ، ديجوس ، إل ، جاليبرت ، إف ، أند هورز ، جي مزيج من HLA-DQ beta Asp57-negative و HLA DQ alpha Arg52 يمنح القابلية للإصابة بمرض السكري المعتمد على الأنسولين. جي كلين إنفست 85: 1315–1319, 1990

Khanna، R.، Burrows، SR، Kurilla، MG، Jacob، CA، Misko، IS، Sculley، TB، Kieff، E.، and Moss، DJ توطين حاتمات الخلايا التائية السامة للخلايا لفيروس إبشتاين بار باستخدام اللقاح المؤتلف: الآثار المترتبة على تطوير لقاح. J Exp Med 176: 169–176, 1992

Kinouchi، R.، Kobayashi، H.، Sato، K.، Kimura، S.، and Katagiri، M. أشكال الببتيد لجزيئات HLA-DR4 / DR53 (DRB1 * 0405 / DRB4 * 0101). علم الوراثة المناعية 40: 376–378, 1994

Klavinskis، L. S.، Whitton، J.L، Joly، E.، and Oldstone، M.B A. التطعيم والحماية من عدوى فيروسية قاتلة: تحديد وإدماج واستخدام حاتمة البروتين السكري T اللمفاوية السامة للخلايا. علم الفيروسات 178: 393–400, 1990

Klein، J. Natural History of the Major Histocompatibility Complex، J. Wiley & amp Sons، New York، 1986

Koenig، S.، Fuerst، TR، Wood، LV، Woods، RM، Suzich، JA، Jones، GM، De la Cruz، VF، Davey، RT Jr.، Venkatesan، S.، Moss، B.، Biddison، WE ، و Fauci، AS رسم خرائط للخصوصية الدقيقة لاستجابة الخلايا التائية الحالة للخلايا لفيروس HIV-1 نيف بروتين. J إمونول 145: 127–135, 1990

Koziel، M. J إمونول 149: 3339–3344, 1992

Kropshofer ، H. ، Max ، H. ، Müller ، CA ، Hesse ، F. ، Stevanović ، S. ، Jung ، G. ، and Kalbacher ، H. يعرض الببتيد الذاتي المنطلق من الفئة II HLA-DR1 بقايا ثنائية كارهة للماء عزر الاتصال. J Exp Med 175: 1799–1803, 1992

Kropshofer ، H. ، Max ، H. ، Halder ، T. ، Kalbus ، M. ، Müller ، C.A ، and Kalbacher ، H. Self-peptides from four HLA-DR تشترك الأليلات في بقايا المرساة الكارهة للماء بالقرب من محطة NH2 بما في ذلك البرولين كإشارة توقف للتشذيب. J إمونول 151: 4732–4742, 1993

Kubo، RT، Sette، A.، Gray، HM، Appella، E.، Sakaguchi، K.، Zhu، NZ، Arnott، D.، Sherman، N.، Shabanowitz، J.، Michel، H.، Bodnar، WM ، Davis ، TA ، و Hunt ، DF تعريف أشكال محددة من الببتيد لأربعة أقسام رئيسية HLA-A الأليلات. J إمونول 152: 3913–3924, 1994

Kulkarni، A.B، Morse، III، H.C، Bennink، J.R، Yewdell، J.W، and Murphy، B.R. ياء فيرول 67: 4086–4092, 1993

كومار ، إس ، ميلر ، إل إتش ، كواكي ، آي إيه ، كيستر ، دي بي ، هوتن ، آر إيه مالوي ، دبليو إل ، موس ، بي ، بيرزوفسكي ، جي إيه ، وجود ، إم إف الخلايا السامة للخلايا الخاصة بالبروتين المحيطي من المتصورة المنجلية. طبيعة 334: 258–260, 1988

Kutubuddin ، M. ، Simons ، J. ، and Chow ، M. يتم توطين حواتم الخلايا التائية المحللة للخلايا في الفئران لتحييد المناطق المستضدية. ياء فيرول 66: 5967–5974, 1992

Kuwano ، K. ، Braciale ، T. J. ، and Ennis ، F. A. توطين حاتمة CTL عبر رد الفعل إلى منطقة الغشاء من hemagglutinin لفيروسات الأنفلونزا H1 و H2. FASEB J 2: 2221, 1988

Larson، J.K، Wunner، W.H، Otvos، Jr.، L.، and Ertl، H. C. ياء فيرول 65: 5673–5679, 1991

Lee، SP، Thomas، SA، Murray، RJ، Khanim، F.، Faur، S.، Young، LS، Rowe، M.، Kurilla، M.، and Rickinson، AB HLA A2.1-limited cytotoxic T-cells التعرف على مجموعة من عزلات فيروس Epstein-Barr من خلال حاتمة محددة في بروتين الغشاء الكامن LMP2. ياء فيرول 67: 7428–7435, 1993

Lethé ، B. ، Van den Eynde ، B. ، Van Pel ، A. ، Corradin ، G ، and Boon ، T. Eur J Immunol 22: 2283–2288, 1992

Littua، RA، Oldstone، MBA، Takeda، A.، Debouck، C.، Wong، JT، Tuazon، CU، Moss، B.، Kievits، F.، and Ennis، FA An HLA-C المقيدة CD8 + السامة للخلايا T lymphocyte clone يتعرف على حاتمة محفوظة للغاية على فيروس نقص المناعة البشرية من النوع 1 gag. ياء فيرول 65: 4051–4056, 1991

Lurquin ، C. ، Van Pel ، A. ، Mariamé ، B. ، De Plaen ، E. ، Szikora ، J.-P. ، Janssens ، C. ، Reddehase ، MJ ، Lejeune ، J. ، and Boon ، T. Structure من جين مستضد زرع الورم P91A: يقوم exon المتحول بترميز الببتيد المعترف به بواسطة L d بواسطة الخلايا التائية الحالة للخلايا. الخلية 58: 293–303, 1989

Madden ، D. R. ، Garboczi ، D.N ، and Wiley ، D.C. التعريف المستضدي لمجمعات الببتيد- معقد التوافق النسيجي الكبير - مقارنة بين مطابقة خمسة ببتيدات فيروسية مقدمة من HLA-A2. الخلية 75: 693–708, 1993

ماير ، ر. ، فالك ، ك. ، روتزشك ، أو. ، ماير ، ب ، جناو ، ف ، ستيفانوفيتش ، إس ، يونج ، ج ، رامينسي ، إتش- جي ، ومايرهانز ، زخارف ببتيد من جزيئات HLA-A3 و -A24 و-B7 كما هو محدد بواسطة تسلسل التجمع. علم الوراثة المناعية 40: 306–308, 1994

Malcherek، G.، Falk، K.، Rötzschke، O.، Rammensee، H.-G.، Stevanović، S.، Gnau، V.، Jung، G.، and Melms، A. Natural peptide ligand Motifs of two HLA الجزيئات المرتبطة بالوهن العضلي الشديد. Int إمونول 5: 1229–1237, 1993

Mandelboim، O.، Berke، G.، Fridkin، M.، Feldman، M.، Einstein، M.، and Eisenbach، L. CTL تحريض بواسطة octapeptide مستضد مرتبط بالورم مشتق من سرطان الرئة الفئران. طبيعة 369: 67–71, 1994

Marrack ، P. ، Ignatowicz ، L. ، Kappler ، J.W ، Boymel ، J. ، and Freed ، J.H. مقارنة الببتيدات المرتبطة بالطحال والغدة الصعترية من الدرجة الثانية. J Exp Med 178: 2173–2183, 1993

Martin ، R. ، Howell ، MD ، Jaraquemada ، D. ، Flerlage ، M. ، Richert ، J. ، Brostoff ، S. ، Long ، EO ، McFarlin ، DE ، and McFarland ، HF يتم التعرف على ببتيد البروتين المايلين الأساسي بواسطة السامة للخلايا الخلايا التائية في سياق أربعة أنواع من HLA-DR المرتبطة بالتصلب المتعدد. J Exp Med 173: 19–24, 1991

Maryanski، J.L، Pala، P.، Corradin، G.، Jordan، B. R.، and Cerottini، J.-C يمكن للخلايا التائية الحالة للخلايا المقيدة بـ H-2 والمخصصة لـ HLA التعرف على ببتيد HLA الاصطناعي. طبيعة 324: 578–579, 1986

ماتسوشيتا ، S. ، تاكاهاشي ، K. ، Motoki ، M. ، Komoriya ، K. ، Ikagawa ، S. ، و Nishimura ، Y. خصوصية المتطلبات الهيكلية للببتيدات المرتبطة بمجمعات HLA-DRB1 * 0405 and-DRB1 * 0406 : الآثار المترتبة على قابلية HLA المرتبطة بمتلازمة المناعة الذاتية التي يسببها الأنسولين. J Exp Med 180: 873–883, 1994

Missale، G.، Redeker، A.، Person، J.، Fowler، P.، Guilhot، S.، Schlicht، HJ، Ferrari، C.، and Chisari، FV HLA-A31- and HLA-A w 68-limited استجابات الخلايا التائية السامة للخلايا لحلقة نواة واحدة لفيروس التهاب الكبد B أثناء التهاب الكبد الفيروسي الحاد. J Exp Med 177: 751–762, 1993

Momburg ، F. ، Neefjes ، J. J. ، and Hämmerling ، G. J. أوبن بالعملة إمونول 6: 32–37, 1994

Nayersina، R.، Fowler، P.، Guilhot، S.، Missale، G.، Cerny، A.، Schlicht، HJ، Vitiello، A.، Chesnut، R.، Person، JL، Redeker، AG، and Chisari، قام FV HLA-A2 بتقييد استجابات الخلايا اللمفاوية التائية السامة للخلايا للعديد من حواتم مستضد التهاب الكبد B السطحي أثناء عدوى فيروس التهاب الكبد B. J إمونول 150: 4659–4671, 1993

Neefjes ، J. J. and Momburg ، F. بيولوجيا الخلية لعرض المستضد. أوبن بالعملة إمونول 5: 27–34, 1993

Nelson، C.A، Roof، R.W، McCourt، D.W، and Unanue، E.R. Proc Natl Acad Sci USA 89: 7380–7383, 1992

Newcomb، J.R and Cresswell، P. توصيف الببتيدات الداخلية المرتبطة بجزيئات HLA-DR المنقى وغيابها من ثنائيات ألفا بيتا المرتبطة بالسلسلة الثابتة. J إمونول 150: 499–507, 1993

نوردا ، إم ، فالك ، ك. ، روتزشك ، أو. ، ستيفانوفيتش ، إس ، يونج ، جي ، ورامينسي ، إتش- جي. مقارنة بين الأشكال الببتيدية المقيدة H-2K k و H-2K kml. جي إمونوثر 14: 144–149, 1993

O'Sullivan، D.، Arrhenius، T.، Sidney، J.، Del Guercio، M.-F.، Albertson، M.، Wall، M.، Oseroff، C.، Southwood، S.، Colon، SM، Gaeta و FCA و Sette ، A. حول تفاعل الببتيدات المستضدية المختلطة مع مختلف الدكتور الأليلات. تحديد الأشكال الهيكلية الشائعة. J إمونول 147: 2663–2669, 1991

Oldstone ، M.B A. ، Whitton ، J.L ، Lewicki ، H. ، and Tishon ، A. تشريح دقيق لحلقة بروتين سكري تسعة أحماض أمينية ، محدد رئيسي تم التعرف عليه بواسطة الخلايا الليمفاوية التائية السامة المشيمية الليمفاوية من الفئة I المقيدة H-2D b الخلايا الليمفاوية التائية السامة للخلايا. J Exp Med 168: 559–570, 1988

Oldstone، M.B A.، Tishon، A.، Eddleston، M.، De La Torre، J.C، McKee، T.، and Whitton، J.L Vaccination لمنع العدوى الفيروسية المستمرة. ياء فيرول 67: 4372–4378, 1993

Ortmann ، B. ، Androlewicz ، M.J ، and Cresswell ، P. MHC class I beta2-microglobulin مجمعات مرتبطة بناقلات Tap قبل ربط الببتيد. طبيعة 368: 364–867, 1994

Pamer ، E.G ، Harty ، J. T. ، and Bevan ، M. J. الطبيعة 353: 852–855, 1991

Pamer ، E.G. تحديد التسلسل المباشر والتحليل الحركي لفئة معقد التوافق النسيجي الكبير من الدرجة الأولى Listeria monocytogenes CTL epitope. J إمونول 152: 686–694, 1994

باركر ، K.C ، Bednarek ، M.A ، and Coligan ، J.E Scheme لترتيب ببتيدات ربط HLA-A2 المحتملة بناءً على الارتباط المستقل للسلاسل الجانبية الببتيدية الفردية. J إمونول 152: 163–175, 1994

فايفر ، جيه دي ، ويك ، إم جيه ، روبرتس ، آر إل ، فيندلاي ، ك ، نورمارك ، إس جيه ، وهاردينج ، سي في معالجة البلعمة للمستضدات البكتيرية للعرض الأول من معقد التوافق النسيجي الكبير على الخلايا التائية. طبيعة 361: 359–362, 1993

Phillips، RE، Rowland-Jones، S.، Huet، S.، Hill، A.، Sutton، J.، Murray، R.، Brooks، J.، and McMichael، A. التعرف على الخلايا التائية. طبيعة 354: 453–459, 1991

Pinet ، V. ، Malnati ، M. S. ، and Long ، E. O. مساران للمعالجة لعرض MHC من الدرجة الثانية المقيد لمستضد فيروس الأنفلونزا الخارجي. J إمونول 152: 4852–4860, 1994

Rammensee ، H.-G. ، Falk ، K. ، and Rötzschke ، O. الببتيدات التي يتم تقديمها بشكل طبيعي بواسطة جزيئات MHC من الفئة الأولى. Annu Rev Immunol 11: 213–244, 1993

Rawle، FC، O'Connell، KA، Geib، RW، Roberts، B.، and Gooding، LR Fine mapping of a H-2K k المقيدة للخلايا اللمفاوية التائية في مستضد SV 40 T باستخدام طفرات حذف في الإطار و a الببتيد الاصطناعي. J إمونول 141: 2734–2739, 1988

Reay ، P. A. ، Kantor ، R. M. ، and Davis ، M.M. استخدام بدائل الأحماض الأمينية العالمية لتحديد متطلبات ربط معقد التوافق النسيجي الكبير والتعرف على الخلايا التائية لعثة السيتوكروم سي (93-103). J إمونول 152: 3946–3957, 1994

Reddehase ، M. J. ، Rothbard ، J.B ، and Koszinowski ، U. H. طبيعة 337: 651–653, 1989

Reich، E. P.، Von Grafenstein، H.، Barlow، A.، Swenson، K.E، Williams، K.، and Janeway، C.A peptides Self المعزولة من MHC glycoproteins of non Danetic السكري الفئران. J إمونول 152: 2279–2288, 1994

Riberdy ، J.M ، Newcomb ، J.R ، Surman ، M.J ، Barbosa ، J.A ، and Cresswell ، P. ترتبط جزيئات HLA-DR من خط خلية متحولة لمعالجة المستضد بببتيدات سلسلة ثابتة. طبيعة 360: 474–477, 1992

روبينز ، P. A. ، Lettice ، L.A ، Rota ، P. ، Santos-Aguado ، J. ، Rothbard ، J. ، McMichael ، A. J. ، and Strominger ، J.L. دليل على مواقع منفصلة داخل HLA-A2. J إمونول 143: 4098–4103, 1989

روبينز ، ب.ف ، الجميل ، م ، كاواكامي ، واي. ، روزنبرغ ، س.أ. التعرف على التيروزيني عن طريق الخلايا الليمفاوية المتسللة للورم من مريض يستجيب للعلاج المناعي. الدقة 54 السرطان: 3124–3126, 1994

Rock، K.L، Rohhstein، L.، Gamble، S.، and Fleischacker، C. توصيف الخلايا العارضة للمستضد التي تقدم مستضدات خارجية بالاشتراك مع جزيئات الصنف الأول من معقد التوافق النسيجي الكبير. J إمونول 150: 438–446, 1993

Rock، KL، Gramm، C.، Rothstein، L.، Clark، K.، Stein، R.، Dick، L.، Hwang، D.، and Goldberg، AL Inhibitors of the proteasome تمنع تحلل معظم بروتينات الخلية و يتم تقديم جيل الببتيدات على جزيئات معقد التوافق النسيجي الكبير من الدرجة الأولى. الخلية 78: 761–771, 1994

Romero ، P. ، Maryanski ، J.L ، Corradin ، G. ، Nussenzweig ، R. S. ، Nussenzweig ، V. ، and Zavala ، F. طبيعة 341: 323–326, 1989

روميرو ، P. ، Corradin ، G. ، Leuscher ، I. F. ، و Maryanski ، J.LH-2K d- الببتيدات المستضدية المقيدة تشترك في شكل ربط بسيط. J Exp M Med 174: 603–612, 1991

Rötzschke، O.، Falk، K.، Deres، K.، Schild، H.، Norda، M.، Metzger، J.، Jung، G.، and Rammensee، H.-G. عزل وتحليل الببتيدات الفيروسية المعالجة بشكل طبيعي على النحو المعترف به من قبل الخلايا التائية السامة للخلايا. طبيعة 348: 252–254, 1990

Rötzschke، O.، Falk، K.، Stevanovi، S.، Jung، G.، Walden، P.، and Rammensee، H.-G. التنبؤ الدقيق بحلقة الخلايا التائية الطبيعية. Eur J إمونول 21: 2891–2894, 1991

Rötzschke، O.، Falk، K.، Stevanović، S.، Jung، G.، and Rammensee، H.-G. تشمل الأشكال الببتيدية لجزيئات HLA من الفئة الأولى اختلافات جوهرية. Eur J Immunol 22: 2453–2456, 1992

Rötzschke، O.، Falk، K.، Stevanović، S.، Grahovac، B.، Soloski، M.J، Jung، G.، and Rammensee، H.-G. جزيئات Qa-2 هي مستقبلات ببتيدية ذات صرامة أعلى من جزيئات الصنف الأول العادية. طبيعة 361: 642–644, 1993

Rötzschke، O.، Falk، K.، Stevanović، S.، Gnau، V.، Jung، C.، and Rammensee، H.-G. مرساة طرفية عطرية / أليفاتية سائدة في أشكال الببتيد HLA-B * 2702 و B * 2705. علم الوراثة المناعية 39: 74–77, 1994

Rötzschke، O. and Falk، K. أصل وهيكل وزخارف لروابط MHC من الدرجة الثانية المعالجة بشكل طبيعي. أوبن بالعملة إمونول 6: 45–51, 1994

Rudensky ، A. Y. ، Preston-Hurlburt ، P. ، Hong ، S.-C ، Barlow ، A. ، and Janeway ، C.A. تحليل تسلسل الببتيدات المرتبطة بجزيئات MHC من الدرجة الثانية. الطبيعة 353: 622–627, 1991

Rudensky ، A. Y. ، Preston-Hurlburt ، P. ، Al-Ramadi ، B.K ، Rothbard ، J. ، and Janeway ، C. الطبيعة 359: 429–431, 1992

Ruppert ، J. ، Sidney ، J. ، Celis ، E. ، Kubo ، R. T. ، Gray ، H.M ، and Sette ، A. الدور البارز لبقايا المرساة الثانوية في ربط الببتيد بجزيئات HLA-A2.1. الخلية 74: 929–937, 1993

Schulz، M.، Aichele، P.، Schneider، R.، Hansen، T.H، Zinkernagel، R.M، and Hengartner، H. Eur J إمونول 21: 1181–1185, 1991

Schumacher، T. N.، De Bruijin، M. L.، Vernie، L.N، Kast، W.M، Melief، C.JM، Neefjes، J.J، and Ploegh، H. طبيعة 350: 703–706, 1991

Sette ، A. ، Buus ، S. ، Appella ، E. ، Smith ، J. A. ، Chesnut ، R. ، Miles ، C. ، Colon ، S.M. ، and Gray ، H. M. التنبؤ بمناطق الارتباط المعقدة المعقدة للتوافق النسيجي لمستضدات البروتين عن طريق تحليل نمط التسلسل. Proc Natl Acad Sci USA 86: 3296–3300, 1989

Sette، A.، Ceman، S.، Kubo، RT، Sakaguchi، K.، Appella، E.، Hunt، DF، Davis، TA، Michal، H.، Shabanowitz، J.، Rudersdorf، R.، Gray، HM ، و DeMars ، R. الببتيدات المتسلسلة الثابتة في معظم جزيئات HLA-DR لطافرة معالجة مستضد. العلوم 258: 1801–1804, 1992

Sette، A.، Sidney، J.، Oseroff، C.، Del Guercio، MF، Southwood، S.، Arrhenius، T.، Powell، MF، Colon، SM، Gaeta، FCA، and Gray، HM HLA DR4 w 4 توضح الأشكال الملزمة الأساس الكيميائي الحيوي للانحلال والخصوصية في تفاعلات الببتيد- DR. J إمونول 151: 3163–3170, 1993

Sette، A.، Sidney، J.، Del Guercio، MF، Southwood، S.، Ruppert، J.، Dahlberg، C.، Gray، HM، and Kubo، RT Peptide ملزمة بأليلات HLA-A الأكثر شيوعًا من الدرجة الأولى تقاس بمقايسات الربط الجزيئي الكمي. مول إمونول 31: 813–822, 1994

Shawar، S.M، Vyas، J.M، Rodgers، J.R، Cook، R.G، and Rich، R. R. الوظائف المتخصصة لجزيئات الصنف الأول من التوافق النسيجي الرئيسية. II. Hmt يربط الببتيدات N-formylated من أصل الميتوكوندريا وبكراريوتيك. J Exp Med 174: 941–944, 1991

شيبرد ، جي سي ، شوماخر ، تي إن إم ، أشتون-ريكاردت ، P. الخلية 74: 577–584, 1993

Shirai، M.، Okada، H.، Nishioka، M.، Akatsuka، T.، Wychowski، C.، Houghten، R.، Pendleton، CD، Feinstone، SM، and Berzofsky، JA An epitope in hepatitis C virus area المعترف بها من قبل الخلايا التائية السامة للخلايا في الفئران والبشر. ياء فيرول 68: 3334–3342, 1994

Sibille، C.، Chomez، P.، Wildmann، C.، Van Pel، A.، De Plaen، E.، Maryanski، JL، De Bergeyck، V.، and Boon، T. المستضد P198: تولد الطفرة النقطية ببتيد مستضد جديد. J Exp Med 172: 35–45, 1990

Sijts و AJAM و Ossendorp و F. و Mengede و EAM و Van den Elsen و PJ و Melief و CJM Immunodominant mink cell التركيز الذي يحفز فيروس سرطان الدم الفئران (MuLV) المشفر CTL ، والذي تم تحديده بواسطة نموذج ربط MHC من الدرجة الأولى ، يوضح MuLV - خصوصية نوع الخلايا الليمفاوية التائية السامة للخلايا الموجهة MCF. J إمونول 152: 106–116, 1994

Silver، M.L، Guo، H.C، Strominger، J.L، and Wiley، D.C. التركيب الذري لجزيء MHC بشري يقدم ببتيدًا لفيروس الأنفلونزا. طبيعة 360: 367–369, 1992

Sinigaglia، F. and Hammer، J. تحديد قواعد تفاعل الببتيد- MHC من الدرجة الثانية. أوبن بالعملة إمونول 6: 52–56, 1994

Spouge ، J.L ، Guy ، H. R. ، Cornette ، J.L ، Margalit ، H. ، Cease ، K. ، Berzofsky ، J.A ، and DeLisi ، C. J إمونول 138: 204–212, 1987

سريفاستافا ، P. K. ، Udono ، H. ، Blachere ، N. E. ، and Li ، Z.H. بروتينات الصدمة الحرارية تنقل الببتيدات أثناء معالجة المستضد وتهيئة CTL. علم الوراثة المناعية 39: 93–98, 1994

Starnbach، M.N and Bevan، M. J. تقدم الخلايا المصابة بـ Yersinia حاتمة للفئة I MHC المقيدة CTL. J إمونول 153: 1603–1612, 1994

ستيرن ، إل جيه ، براون ، جيه إتش ، جارديتزكي ، تي إس ، جورجا ، جيه سي ، أوربان ، آر جي ، سترومينجر ، جيه إل ، وايلي ، دي سي هيكل بلوري للفئة البشرية II بروتين معقد التوافق النسيجي الكبير HLA-DR1 معقد مع ببتيد فيروس الأنفلونزا. الطبيعة 215 - 221, 1994

ستيرن ، L.J و Wiley ، D.C. ربط الببتيد المستضدي بواسطة بروتينات التوافق النسيجي من الصنف الأول والفئة الثانية. الهيكل 2: 245–251, 1994

Stevanovi، S. and Rammensee، H.-G. هيكل حواتم الخلية التائية. في إم إتش في فان ريجنمورتيل (محرر) هيكل المستضدات، في الصحافة

Suh ، W. K. ، Cohendoyle ، M.F ، Früh ، K. ، Wang ، K. ، Peterson ، P. A. ، and Williams ، D.B. تفاعل جزيئات معقد التوافق النسيجي الكبير من الدرجة الأولى مع الناقل المرتبط بمعالجة المستضد. العلوم 264: 1322–1326, 1994

ساتون ، جي ، رولاند جونز ، إس ، روزبرغ ، دبليو ، نيكسون ، دي ، جوتش ، إف ، جاو ، إكس إم ، موراي ، إن ، سبوناس ، إيه ، دريسكول ، بي ، سميث ، م ، ويليس ، أ ، وماكمايكل ، أ. نمط تسلسلي للببتيدات قدم إلى الخلايا اللمفاوية التائية السامة للخلايا بواسطة HLA-B8 الذي كشف عنه تحليل الحلقات والببتيدات المزلقة. Eur J إمونول 23: 447–453, 1993

Sweetser ، M. T. ، Morrison ، L.A ، Braciale ، V. L. ، and Braciale ، T. J. طبيعة 342: 180–182, 1989

يولد Szikora ، J. P. ، Van Pel ، A. ، and Boon ، T. Tum-mutation P35b موقع ارتباط معقد التوافق النسيجي الكبير لببتيد مستضد جديد. علم الوراثة المناعية 37: 135–138, 1993

تاكاهاشي ، H. ، كوهين ، J. ، Hosmalin ، A. ، Cease ، KB ، Houghton ، R. ، Cornette ، JL ، DeLisi ، C. ، Moss ، B. ، Germain ، RN ، and Berzofsky ، JA An epitope of immunodominant of غلاف فيروس نقص المناعة البشرية gp160 المعترف به من قبل الخلايا الليمفاوية التائية السامة للخلايا السامة للخلايا من الفئة الأولى من الفئة الأولى. Proc Natl Acad Sci USA 85: 3105, 1988

تاكاهاشي ، K. ، Dai ، LC ، Fuerst ، T. ، Biddison ، WE ، Earl ، P. ، Moss ، B. - استنساخ الخلايا الليمفاوية التائية CD8 السامة للخلايا والذي يتعرف على تسلسل الببتيد المحفوظ داخل الوحدة الفرعية gp41 لبروتين الغلاف. Proc Natl Acad Sci USA 88: 10277–10281, 1991

Tarpey و I. و Stacey و S. و Hickling و J. و Birley و HDL و Renton و A. و Mcindoe و A. شكل HLA-A2 (A * 0201). علم المناعة 81: 222–227, 1994

تيفيثيا ، إس إس ، لويس ، إم ، تاناكا ، واي ، ميليسي ، جي ، نولز ، بي ، مالوي ، دبليو إل ، أندرسون ، آر تشريح من ح-2D b حواتم الخلايا اللمفاوية التائية السامة للخلايا على مستضد فيروس Simian 40 T باستخدام الببتيدات الاصطناعية و ح-2D bm المسوخ. ياء فيرول 64: 1192–1200, 1990

Todd، J. A.، Bell، J. I، and McDevitt، H. O. HLA-DQ beta gene يسهم في الحساسية والمقاومة لمرض السكري المعتمد على الأنسولين. طبيعة 329: 599–604, 1987

تاونسند ، A. ، Öhlén ، C. ، Bastin ، J. ، Ljunggren ، H.-G. ، Foster ، L. ، and Kärre ، K. طبيعة 340: 443–448, 1989

تاونسند ، أ ، أولين ، سي ، روجرز ، إم ، إدواردز ، جيه ، موخيرجي ، س ، وباستين ، ج. مصدر مستضدات الورم الفريدة. طبيعة 371: 662, 1994

تاونسند ، أ.ر. ، روثبارد ، جيه ، جوتش ، إف إم ، بهادور ، جي ، رايث ، دي ، وماكمايكل ، إيه.جيه. الخلية 44: 959–968, 1986

ترافيرساري ، سي ، فان دير بروجن ، بي ، لويشر ، آي إف ، لوركين ، سي ، تشوميز ، بي ، فان بيل ، إيه ، دي بلان ، إي ، أمار-كوستيسك ، إيه ، وبون ، تي. نوناببتيد مشفر بواسطة الجين البشري بركه -1 تم التعرف عليه على HLA-A1 بواسطة الخلايا الليمفاوية التائية الحالة للخلايا الموجهة ضد مستضد الورم MZ2-E. J Exp Med 176: 1453–1457, 1992

Udaka، K.، Tsomides، T. J.، and Eisen، H.N. هو ببتيد طبيعي المنشأ معترف به من قبل الخلايا اللمفاوية التائية السامة للخلايا CD8 + بالاشتراك مع بروتين من الدرجة الأولى. الخلية 69: 989–998, 1992

Ukaka، K.، Tsomides، T. J.، Walden، P.، Fukusen، N.، and Eisen، H.N. البروتين في كل مكان هو مصدر الببتيدات التي تحدث بشكل طبيعي والتي يتعرف عليها استنساخ خلايا CD8 + T. Proc Natl Acad Sci USA 90: 11272–11276, 1993

Urban و RG و Chicz و RM و Lane و WS و Strominger و JL و Rehm و A. و Kenter و MJH و Uytdehaag و FGCM و Ploegh و H. و Uchanska-Ziegler و B. تحتوي جزيئات -B27 على ببتيدات أطول بكثير من جزيئات nonamers. Proc Natl Acad Sci USA 91: 1534–1538, 1994

Utz، U.، Koenig، S.، Coligan، JE، and Biddison، WE يتم تحديد عرض WE لثلاثة ببتيدات فيروسية مختلفة ، HTLV-1 Tax ، HCMV gB ، وفيروس الأنفلونزا M1 ، من خلال السمات الهيكلية المشتركة لـ HLA-A2. 1 جزيء. J إمونول 149: 214–221, 1992

Van Binnendijk و RS و Versteeg van Oosten و JP و Poelen و MC و Brugghe و HF و Hoogerhout و P. و Osterhaus و AD و Uytdehaag و FG Human HLA class I- و HLA class II المقيدة بالخلايا التائية المستنسخة السامة للخلايا تحدد مجموعة من الحلقات على بروتين اندماج فيروس الحصبة. ياء فيرول 67: 2276–2284, 1993

Van Bleek ، G.M and Nathenson ، S.G. عزل الببتيد الفيروسي المناعي من الصنف I H-2K b جزيء. طبيعة 348: 213–216, 1990

Van der Bruggen، P.، Traversari، C.، Chomez، P.، Lurquin، C.، De Plaen، E.، Van den Eynde، B.، Knuth، A.، and Boon، T. A gene encoding an antigen تم التعرف عليها بواسطة الخلايا اللمفاوية التائية الحالة للخلايا على سرطان الجلد البشري. العلوم 254: 1643–1647, 1991

Venet ، A. and Walker ، B. D. حواتم الخلايا التائية السامة للخلايا في عدوى فيروس نقص المناعة البشرية SIV. الإيدز 7: S117-S126 ، 1993

Vogt ، AB ، Kropshofer ، H. ، Kalbacher ، H. ، Kalbus ، M. ، Rammensee ، H.-G. ، Coligan ، JE ، and Martin ، R. Ligand أشكال HLA-DRB5 * 0101 و DRB1 * 1501 جزيئات محددة من الببتيدات الذاتية. J إمونول 153: 1665–1673, 1994

Von Boehmer، H. اختيار الزعتر - مسألة حياة أو موت. إمونول اليوم 13: 454–458, 1992

ووكر ، بي دي ، فليكسنر ، سي ، بيرش ليمبيرجر ، K. ، فيشر ، L. ، Paradis ، TJ ، Aldovini ، A. ، Young ، R. ، Moss ، B. ، and Schooley ، RT Long-term Culture and fine خصوصية استنساخ الخلايا اللمفاوية التائية السامة للخلايا البشرية المتفاعلة مع نوع فيروس نقص المناعة البشرية. Proc Natl Acad Sci USA 86: 9514–9518, 1989

والني ، هـ. Untersuchungen zur Rolle der MHC-Klasse-I-Moleküle bei der Prozessierung von Nobenhistokompatibilitätsantigenen، Dissertation Universität Tübingen، 1992

Wallny ، H.-J. ، Deres ، K. ، Faath ، S. ، Jung ، G. ، Van Pel ، A. ، Boon ، T. ، and Rammensee ، H.-G. تحديد وتقدير كمية الببتيد المقدم بشكل طبيعي كما هو معترف به من قبل الخلايا الليمفاوية التائية السامة للخلايا المحددة لمتغير الورم المناعي. Int إمونول 4: 1085–1090, 1992

تحتوي جزيئات HLA-A2 في خلية متحولة لمعالجة مستضد على ببتيدات مشتقة من تسلسل الإشارة. الطبيعة 356: 443–446, 1992

Weiss، WR، Mellouk، S.، Houghten، RA، Sedegah، M.، Kumar، S.، Good، MF، Berzofsky، JA، Miller، LH، and Hoffmann، SL Cytotoxic T cells تتعرف على الببتيد من البروتين المحيطي الموجود على خلايا الكبد المصابة بالملاريا. J Exp Med 171: 763–773, 1990

الأبيض ، HD ، Roeder ، DA ، والأخضر ، WR هو ببتيد مقيد مناعي K b من بروتين الغشاء P15E لفيروس لوكيميا الفئران الذاتية البيئة (Mulv) Akr623 الذي يعيد قابلية خط الورم إلى مكافحة AKR Gross MULV السامة للخلايا T -الخلايا الليمفاوية. ياء فيرول 68: 897–904, 1994

Whitton، JL، Tishon، A.، Lewicki، H.، Gebhard، J.، Cook، T.، Salvato، M.، Joly، E.، and Oldstone، MBA التحليلات الجزيئية لخمسة أحماض أمينية سامة للخلايا T- حاتمة الخلايا الليمفاوية (CTL): منطقة مناعية تحفز التفاعل التبادلي غير المتبادل لـ CTL. ياء فيرول 63: 4303–4310, 1989

Wölfel، T.، Van Pel، A.، Brichard، V.، Schneider، J.، Seliger، B.، Zum Büschenfelde، KHM، and Boon، T. الخلايا الليمفاوية. Eur J Immunol 24: 759–764, 1994

Wucherpfennig، KW، Sette، A.، Southwood، S.، Oseroff، C.، Matsui، M.، Strominger، JL، and Hafler، DA المتطلبات الهيكلية لربط ببتيد بروتين المايلين الأساسي المناعي بنظائر DR2 وللتعرف عليها بواسطة استنساخ الخلايا التائية البشرية. J Exp Med 179: 279–290, 1994

Yanagi ، Y. ، Tishon ، A. ، Lewicki ، H. ، Cubitt ، B. A. ، and Oldstone ، M.B A. تنوع مستقبلات الخلايا التائية في الخلايا الليمفاوية التائية السامة للخلايا الخاصة بالفيروس والتي تتعرف على 3 حواتم فيروسية مميزة مقيدة بجزيء معقد واحد للتوافق النسيجي. ياء فيرول 66: 2527–2531, 1992

Zhang ، Q. J. ، Gavioli ، R. ، Klein ، G. ، and Masucci ، M. Proc Natl Acad Sci USA 90: 2217–2221, 1993

Zhang ، W. ، Young ، ACM ، Imarai ، M. ، Nathenson ، SG ، and Sacchettini ، JC Crystal Structure of the main histocompatibility complex class I H-2K bolecule الذي يحتوي على ببتيد فيروسي واحد: الآثار المترتبة على ربط الببتيد وخلية T التعرف على المستقبلات. Proc Natl Acad Sci USA 89: 8403–8407, 1992


قم بتنزيل وطباعة هذه المقالة لاستخداماتك العلمية والبحثية والتعليمية الشخصية.

شراء عدد واحد من علم مقابل 15 دولارًا أمريكيًا فقط.

علم

المجلد 369 ، العدد 6506
21 أغسطس 2020

أدوات المادة

الرجاء تسجيل الدخول لإضافة تنبيه لهذه المقالة.

بقلم أوريلي فلوكيجر ، رومان ديلير ، محمد ساسي ، باربرا سوزان سيكست ، بينج ليو ، فريدمان لوس ، كورينتين ريتشارد ، كاثرين رابو ، مريم تيجاني ألو ، آن جالي جوبي ، فابيان لوميتري ، غلاديس فيرير ، ليزا ديروسا ، كوني بي إم دونج ، ، أندريان جاجني ، فيليب جوبيرت ، لويزا دي سوردي ، لوران ديباربيو ، سيلفان سيمون ، كلارا ماريا سكارلاتا ، مها أيوب ، بليندا باليرمو ، فرانشيسكو فاسيولو ، رومان بويدو ، ريتشارد ويلر ، إيفو جومبيرتس بونيكا ، زسوفيا ستريستوبينسز إدواردو باسولي ، نيكولا سيغاتا ، كارلوس لوبيز أوتين ، زولتان شالاسي ، فابريس أندريه ، فاليريو إيبا ، فالنتين كوينيو ، ديفيد كلاتزمان ، جاك بوخاليل ، صابر الخليفية ، ديدييه راولت ، لورانس ألبيجيس ، برنارد إسكودييه ، ألكسندر إيغيرمونت ، فتحية نيستيكو ، فرانسوا جيرينغيلي ، برتراند روتي ، ناتالي لاباريير ، فنسنت كاتوار ، جيدو كرومير ، لورانس زيتفوجل

علم 21 أغسطس 2020: 936-942

يمكن للعاثية الموجودة في البكتيريا المتعايشة أن تعدل آثار العلاج المناعي للسرطان.


شاهد الفيديو: انواع الببتايد. الجرع وافضل اوقات الاستخدام (يوليو 2022).


تعليقات:

  1. Dinos

    يمكن وينبغي مناقشة هذا :) إلى ما لا نهاية

  2. Petre

    السؤال الترفيهي للغاية

  3. Dikora

    أعني ، أنت تسمح بالخطأ. أدخل سنناقشها.

  4. Mazusida

    يا لها من إجابة رشيقة

  5. Mushura

    مرحبًا ، لا أعرف أين أكتب سأكتب هنا. لقد اشتركت في RSS من موقعك ، ويتم عرض النص في الهيروغليفية ، الرجاء مساعدتي عبر البريد الإلكتروني

  6. Nikozragore

    في رأيي لم تكن على حق. يمكنني ان ادافع عن هذا المنصب. اكتب لي في رئيس الوزراء ، سوف نتحدث.

  7. Khayri

    بالتاكيد. يحدث ذلك. يمكننا التواصل حول هذا الموضوع. هنا أو في PM.



اكتب رسالة