معلومة

الربط اختلال التوازن

الربط اختلال التوازن


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

أريد أن أعرف ما هي نطاقات القيمة التي يمكن أن تتخذها D 'في اختلال التوازن؟ لأنني قرأت في كتابي (مقدمة إلى علم الوراثة السكانية من قبل Nielsen و Slatkin) أن D 'مضمون لتكون بين 0 و 1. بينما في الرابط الموضح أدناه ، تقول D' يمكن أن تكون بين -1 و 1.

http://csg.sph.umich.edu/abecasis/class/666.03.pdf

هل يمكن لأحد أن يشرح هذا التناقض؟ لأنني الآن في حيرة من أمري.


بيت القصيد حول استخدامد'بدلا مندلأند'يحدها بين -1 و 1 لأي ​​تردد أليل ، بينما حدود لـديعتمد على تردد الأليل من الفائدة.

أذكر تعريفد

$$ D = p_ {ab} - p_ap_b $$

لنفترض أن $ D_ {min} $ و $ D_ {max} $ هما الحد الأدنى والأقصى لقيم $ D $ لتردد أليل معين.

بالنسبة إلى $ p_a = p_b = 0.5 $ ، يكون $ D_min $ عندما يكون $ p_ {ab} = 0 $ ($ D_ {min} = -0.25 $) و $ D_ {max} $ عندما يكون $ p_ {ab} = 1 $ ($ D_ {max} = 0.75 $).

بالنسبة إلى $ p_a = 0.8 $ و $ p_b = 0.2 $ ، يكون $ D_min $ عندما يكون $ p_ {ab} = 0 $ ($ D_ {min} = -0.16 $) و $ D_ {max} $ عندما يكون $ p_ {ab} = 0.2 $ ($ D_ {max} = 0.04 $).


الربط اختلال التوازن

يشير عدم توازن الارتباط (LD) إلى الارتباط بين الأليلات المجاورة ، مما يعكس أصل النمط الفرداني المشترك. في 10 مايو الطبيعة ، الرايخ وآخرون. وصف التحليل المنهجي على مستوى الجينوم لصعوبة التعلم داخل السكان (طبيعة سجية 2001, 411:199-204). قاموا بتحليل 19 منطقة كروموسومية عشوائية ، كل منها تتمحور حول SNP (تعدد الأشكال أحادي الطول) في منطقة الترميز للجين. حدد التسلسل المكثف لـ 44 فردًا من ولاية يوتا 272 من SNPs "عالية التردد" عند 0-160 كيلو قاعدة (kb) من النواة SNP الأساسية. قام المؤلفون بقياس LD بين اثنين من SNPs باستخدام الإحصاء الكلاسيكي D '. ووجدوا أن نصف الطول LD (المسافة التي تنخفض فيها قيمة D 'المتوسطة إلى أقل من 0.5) كانت حوالي 60 كيلو بايت ، وهي أطول بكثير من التوقعات السابقة. تم العثور على تقديرات LD مماثلة لسكان الولايات المتحدة وشمال أوروبا ، ولكنها كانت أقصر بشكل ملحوظ (نصف طول أقل من 5 كيلو بايت) في السكان النيجيريين. يقترح المؤلفون أنه يمكن تطبيق تحليل صعوبة التعلم على نطاق واسع لرسم خرائط جينات المرض ودراسة التاريخ السكاني.


اختلال التوازن ودراسات الارتباط في النباتات العليا: الوضع الحالي والآفاق المستقبلية

خلال العقدين الماضيين ، تم استخدام الواسمات الجزيئية القائمة على الحمض النووي على نطاق واسع لمجموعة متنوعة من الدراسات في كل من النظم النباتية والحيوانية. أحد الاستخدامات الرئيسية لهذه العلامات هو بناء خرائط جزيئية على مستوى الجينوم والتحليل الجيني للسمات البسيطة والمعقدة. ومع ذلك ، فإن هذه الدراسات تستند عمومًا إلى تحليل الارتباط في رسم خرائط السكان ، مما يضع قيودًا خطيرة على استخدام الواسمات الجزيئية للتحليل الجيني في مجموعة متنوعة من الأنظمة النباتية. لذلك ، تم اقتراح مناهج بديلة ، ويستخدم أحد هذه الأساليب تحليل الارتباط القائم على اختلال التوازن (LD). على الرغم من أن هذا النهج لتحليل الارتباط قد تم استخدامه بالفعل للدراسات حول الوراثة للسمات المعقدة (بما في ذلك الأمراض المختلفة) لدى البشر ، إلا أن استخدامه في النباتات قد بدأ للتو. في المراجعة الحالية ، نقوم أولاً بتعريف والتمييز بين صعوبة التعلم وتخطيط الارتباط ، ثم وصف بإيجاز المقاييس المختلفة لصعوبة التعلم وطريقتين لتصويرها. ثم نعطي قائمة بالعوامل المختلفة التي تؤثر على صعوبة التعلم دون مناقشتها ، وكذلك نناقش القضايا الحالية لأبحاث صعوبة التعلم في النباتات. لاحقًا ، قمنا أيضًا بوصف الاستخدامات المختلفة لإعاقة التعلم في أبحاث الجينوميات النباتية ولخص الوضع الحالي لأبحاث صعوبة التعلم في جينومات النباتات المختلفة. في النهاية ، نناقش بإيجاز الآفاق المستقبلية لبحوث صعوبة التعلم في النباتات ، ونقدم قائمة بالبرامج المفيدة في أبحاث صعوبة التعلم ، والمتوفرة كمواد تكميلية إلكترونية (ESM).


عروض خاصه وترويجات للمنتج

من الغلاف الخلفي

مع استمرار الباحثين في تحقيق تقدم هائل في رسم خرائط جينات المرض ، ظهرت تحليلات مثيرة وجديدة ومعقدة. في ارتباط اختلال التوازن ورسم خرائط الارتباط: التحليل والتطبيقات ، يساهم العلماء من جميع أنحاء العالم ، وهم رواد في هذا المجال ، بخبراتهم وخبراتهم الواسعة لإنتاج نص شامل ورائع للباحثين والأطباء على حد سواء.

يتألف المجلد من أربعة أقسام عامة: يقدم الأول نظرة عامة وأساسًا تاريخيًا للموضوع. يتناول القسم الثاني منهجية التطوير والنتائج الحديثة من الدراسات التي ميزت بنية اختلال التوازن على مستوى الجينوم بتفاصيل هائلة. يفحص القسم التالي جميع جوانب منهجية رسم خرائط ارتباط الأمراض ، ويستعرض الفصلان الأخيران النجاحات المبكرة في رسم خرائط الجينات المشاركة في اثنين من أهم الأمراض البشرية: الربو والسكري من النوع 2.


مناقشة

من الصعب توصيف أنماط كتلة صعوبة التعلم والنمط الفرداني في مجموعتين أو أكثر من المجموعات السكانية العشوائية غير المرتبطة بناءً على خريطة صعوبة التعلم واثنين من قياسات عدم توازن الارتباط. استنادًا إلى دراسات نمط صعوبة التعلم في المجموعات البشرية ، أوضحت خرائط صعوبة التعلم أن الكروموسومات البشرية لها نمط من مناطق LD (الهضاب أو البقع الباردة) ، متداخلة مع مناطق ذات معدل إعادة تركيب مرتفع (خطوات أو نقاط ساخنة) [25 ، 26 ]. كلا المنطقتين متغيرتان من حيث العدد والطول ، وتظهر البقع الباردة متساوية (كما هو مفترض في هذه الدراسة) أو LDU مشابه في وحدات LDU. تقدم النقاط الساخنة وحدات LDU مميزة. شوهد نفس النمط في خرائط LD لكروموسومات السكان ثنائي الوالدين ، والتي تم تطويرها بكثافة عالية كما أوصى Pengelly وآخرون. [25]. لفهم مستوى LD في المناطق الساخنة والباردة بشكل أفضل ، قمنا بتحليل جزأين متطرفين من خريطة الكروموسوم 1 LD ، بما في ذلك 30 SNPs. كلا الجزأين لهما أطوال متشابهة في وحدات LDU (4.1 و 3.6) و kb (970 و 828). المتوسط ​​| D '| كان أكبر بكثير بالنسبة إلى تعدد الأشكال في البقع الباردة السبعة (بما في ذلك ثلاثة إلى 12 تعدد الأشكال) بالنسبة لمتوسط ​​قيمة تعدد الأشكال في 21 نقطة ساخنة (بما في ذلك اثنين إلى ثلاثة تعدد الأشكال) (0.89 مقابل 0.29). ومع ذلك ، لم يتم التحقق من ذلك عبر إحصاء r 2 (0.004 مقابل 0.038).

عند مقارنة المجموعات السكانية التي تشترك في أصل مشترك ، ولديها حجم مجتمع فعال مماثل ، ولم تواجه انخفاضًا كبيرًا في الحجم (عنق الزجاجة السكانية) ، يجب أن توفر الإحصائيات D ، D '، و r 2 توصيفًا مشابهًا لنمط صعوبة التعلم إذا توجد ترددات أليل متشابهة. إذا كان للمجموعات توزيعات مميزة للترددات الأليلية ، يمكن استخدام D 'لتحليل تاريخ إعادة التركيب ، ويجب أن يكون r 2 هو الاختيار إذا كان إعادة التركيب والطفرة من العوامل المهمة التي تؤثر على صعوبة التعلم [1]. ومع ذلك ، في العقدين الماضيين ، تهدف معظم الدراسات حول صعوبة التعلم في السكان البشريين إلى تحديد المجموعات السكانية والتعدد السكاني SNPs (وسم SNPs) لدراسات الارتباط [26 ، 27]. بشكل عام ، كلا من | D '| و r 2 تم استخدامها [27 ، 28] ، وبسبب ارتفاع مستوى صعوبة التعلم ، تمت التوصية بالسكان المعزولين لدراسات الارتباط [29]. الإحصاء r 2 هو الأكثر ملاءمة لرسم خرائط الارتباط لأنه يحتوي على علاقة عكسية بسيطة مع حجم العينة المطلوب لاكتشاف الارتباط [1]. استخدام خرائط صعوبة التعلم واثنين من قياسات صعوبة التعلم لمقارنة مجموعات الفشار قدمت بعض النتائج المتناقضة ، ولكن الدليل العام هو أن المجموعة التركيبية هي السكان الذين يعانون من صعوبة التعلم الأعلى. كما هو متوقع ، المتوسط ​​الأدنى | D '| القيمة في عشيرة التكاثر تعكس تاريخ إعادة التركيب. قدم السكان الاصطناعية وثنائي الوالدين متوسطًا أكبر | D '| وتردد أعلى لـ SNPs مع ارتفاع | D '| القيم لأن ليس لديهم تاريخ إعادة التركيب.

نظرًا للاختلافات المتعلقة بنوع الواسم الجزيئي والكثافة ، وحجم العينة ، وتغطية الجينوم ، يجب إجراء مقارنة قيم LD عند الإنسان والحيوانات الأليفة والنباتات بحذر ، حتى عندما تشمل الدراسات نفس النوع. لقد فوجئنا بقيم متوسط ​​r 2 المنخفض وتكرار انخفاض تعدد الأشكال مع قيم r 2 أكبر من 0.25 (تم تعريفه على أنه LD مفيد في بعض الدراسات) في مجموعات الفشار. في دراسة يان وآخرون. [30] ، بما في ذلك 632 سلالة من الذرة الفطرية و 943 SNPs (كثافة SNP واحد لكل 2121 كيلو بايت) ، كان متوسط ​​r 2 0.009 فقط. ومع ذلك ، بالنسبة إلى تعدد الأشكال المفصولة بما يصل إلى 100 كيلو بايت ، كان المتوسط ​​0.2 (0.03 و 0.09 و 0.10 للمجموعات ثنائية الأبوين والاصطناعية والتكاثر ، على التوالي). تم الإبلاغ عن قيم LD أعلى في مجموعة الذرة NAM (رسم خرائط الارتباط المتداخلة) [31] وفي مجموعتين من الأبوين وأربعة مجموعات من FPM (أربعة ذرة من الوالدين) التي درسها أندرسون وآخرون. [9]. بشكل عام ، فإن متوسط ​​قيم r 2 التي لوحظت في مجموعات الفشار هي أيضًا أقل من القيم التي لوحظت في قطعان الماشية والدجاج (0.1 إلى 0.8 لـ SNPs مفصولة بما يصل إلى 100 كيلو بايت) [32-34]. تراوحت الكثافة من 27.8 إلى 112.3 كيلو بايت في هذه الدراسات الثلاث. باستخدام شريحة 600K SNP (كثافة SNP واحدة لكل 6.3 كيلو بايت) ، Pardo وآخرون. [28] لوحظ متوسط ​​r2 الزوجي المتوسط ​​عبر جميع الكروموسومات من 0.015 و 0.016 للمجموعات الهولندية و HapMap-CEU ، على التوالي.

إن عدم وجود معيار موحد لتعريف انحلال صعوبة التعلم ومدى صعوبة التعلم يجعل من الصعب مقارنة النتائج مع الإنسان والحيوان المستأنس ومجموعات النباتات. انجيوس وآخرون. [26] استخدم انحلال LD على أنه المسافة التي ينخفض ​​خلالها متوسط ​​LD إلى نصف قيمته القصوى (نصف الطول). قاموا بتعريف مدى صعوبة التعلم على أنها المسافة التي ينخفض ​​خلالها متوسط ​​صعوبة التعلم إلى قيمة مقاربة. أندرسون وآخرون. [9] استخدم انحلال LD على أنه المسافة التي انخفض خلالها متوسط ​​r 2 إلى أقل من 0.8 ، ومدى LD على أنه المسافة التي انخفض خلالها متوسط ​​r 2 إلى أقل من 0.2. بخصوص تسوس صعوبة التعلم ، أظهرت نتائجنا اختلافات بين مقاييس صعوبة التعلم والمجموعات السكانية. كانت هناك اختلافات طفيفة بين الكروموسومات ، ولكن ارتفاع اضمحلال r2 حدث بعد 5-10 كيلو بايت (36 إلى 73٪). يان وآخرون. [30] لاحظ انحلال LD بنسبة 64٪ بعد 5-10 كيلو بايت في لوحة خطوط فطرية ، ووصل LD إلى قيمة تقارب تقريبية r 2 تبلغ 0.01 في فاصل من 1-5 ميجا بايت (نطاق LD من 5 ميجا بايت). لوحظ مدى LD مشابه (5 ميغا بايت) في ثمانية سلالات من الماشية ، ولكن حدث انحلال LD مشابه (62 ٪) على طول 100 كيلو بايت [35]. من تحليل مقاطع واحد ميغا بايت في جميع الكروموسومات في السكان اليهود الأشكناز والقوقازيين والأمريكيين من أصل أفريقي ، شيفمان وآخرون. [36] لاحظ انحلال LD بنسبة 17 و 21 و 42٪ على طول 10 كيلو بايت على التوالي. حدث مدى LD مشابه قدره 300 كيلو بايت في السكان (وصل إلى قيمة تقارب تقريبية لـ r 2 تبلغ 0.05).

إذا كان هناك معدل LD أعلى بين QTLs والأنماط الفردانية مقارنة مع SNPs الفردية ، يمكن أن توفر كتل النمط الفرداني قوة إحصائية كبيرة في دراسات الارتباط [6] وزيادة دقة التنبؤ الجينومي للسمات المعقدة [37]. بشكل مثير للدهشة ، أظهرت نتائجنا أن عدد وطول كتل النمط الفرداني وعدد SNPs لكل كتلة من النمط الفرداني كان متناسبًا مع متوسط ​​r 2. معيار جبرائيل وآخرون. [6] يبدو أنه يوفر عددًا أقل من SNPs لكل كتلة من النمط الفرداني. في دراسة أجريت على 235 نوعًا من فول الصويا تم تنميطها وراثيًا بواسطة 5،361 SNPs (كثافة SNP واحد لكل 208 كيلو بايت) ، وآخرون. [38] لوحظ ستة تعدد الأشكال لكل كتلة نمط فردى في المتوسط. هذا ليس مفاجئًا لأن مجموعة الأصناف تتوافق مع لوحة خطية نقية (LD مرتفع). في الدراسات التي أجريت على أبقار هولشتاين الألمانية وأربعة تجمعات دجاج ، تراوح متوسط ​​عدد تعدد الأشكال لكل كتلة من النمط الفرداني ما بين أربعة إلى 10 تقريبًا ، وتراوح متوسط ​​طول الكتلة من 146 إلى 799 كيلو بايت تقريبًا [32 ، 33]. لوحظ أيضًا انخفاض متوسط ​​أعداد SNPs لكل كتلة من النمط الفرداني (تقريبًا 4-5) وانخفاض متوسط ​​أطوال كتلة النمط الفرداني (حوالي 5-7 كيلو بايت) في التجمعات البشرية [6 ، 28]. ومع ذلك ، فإن حجم كل كتلة اختلف بشكل كبير في دراسة جبرائيل وآخرون. [6] ، من أقل من واحد إلى 173 كيلوبايت.

فيما يتعلق بانخفاض صعوبة التعلم داخل الجين والحد الأدنى لحجم كتل النمط الفرداني التي لوحظت في المجموعات السكانية الثلاثة ، فإننا نعتقد أن انخفاض صعوبة التعلم لدى السكان ثنائي الوالدين يرجع إلى تهجين سلالتين متشابهتين وراثيًا عالي الجودة. نظرًا لعدم وجود معلومات عن LD وأنماط كتلة النمط الفرداني في المجموعات الأساسية Viçosa و Beija-Flor ، لا يمكننا أن نستنتج أن متوسط ​​قيم r 2 داخل الجين التي لوحظت في المجموعات التركيبية والتكاثرية (لـ 11 من 12 جينًا) مستحقة لاختيار الجودة. توصيف أنماط كتلة LD والنمط الفرداني فيما يتعلق بمناطق كروموسومية معينة تم إجراؤها فقط من قبل علماء الوراثة البشرية ، الذين يهدفون عمومًا إلى وضع علامات على SNP. من تحليل SNPs داخل منطقة HLA على الكروموسوم 6 ، Evseeva وآخرون. [39] لاحظ 18 كتلة من النمط الفرداني في السكان الأوروبيين ، بناءً على معيار غابرييل وآخرون. [6]. علاوة على ذلك ، كان LD أقل قليلاً في الجنوب من سكان شمال أوروبا. باستخدام نفس المعيار ، Nuchnoi وآخرون. [40] لاحظ ستة وأربعة كتل من النمط الفرداني عبر منطقة 472 كيلو بايت على الكروموسوم 5q31-33 في جنوب شرق (تايلاند) وشمال شرق آسيا (الصينيين واليابانيين). أكيساكا وآخرون. [41] حددت مجموعتين إلى ست كتل في السكان الكوريين واليابانيين ، اعتمادًا على معيار كتلة LD ، التي تمتد من 3 إلى 47 كيلو بايت تقريبًا. تراوح متوسط ​​قيمة r 2 للجينات الخمسة في المنطقة من 0.03 إلى 0.89.

في الختام ، مستوى صعوبة التعلم المعبر عنه بقيم r 2 في مجموعات الفشار الثلاثة ذات الهياكل الوراثية المختلفة - مجموعة ثنائية الأبوين ، ومجموعة اصطناعية ، وتكاثر - منخفضة ولكن يمكن مقارنتها ببعض التجمعات البشرية غير المعزولة. لا تعني هذه النتيجة أنه لا يمكن استخدام هذه المجموعات في GWAS نظرًا لوجود جزء من قيم r 2 العالية لـ SNPs مفصولة بأقل من 5 كيلو بايت. لا يتم أيضًا استبعاد المجموعات السكانية للاختيار الجيني لأن العامل الأكثر أهمية الذي يؤثر على عملية الاختيار هذه هو الارتباط بين الأفراد في مجموعات التدريب والتحقق من الصحة. ومع ذلك ، لا نتوقع ميزة كبيرة من GWAS المستندة إلى النمط الفرداني والاختيار الجيني عبر الأجيال بسبب انخفاض عدد SNPs في كتل النمط الفرداني (2 إلى 3). النتائج على اضمحلال LD (الاضمحلال السريع بعد 5-10 كيلو بايت) ومدى اضمحلال LD (على طول حتى 300 كيلو بايت) هي في النطاق الذي لوحظ مع لوحات خط الذرة الفطرية. أهم نتائجنا هي أنه ، على غرار الكروموسومات البشرية ، الذرة (الفشار أيضًا زيا ميس، لكن ssp. ايفيرتا) تحتوي الكروموسومات أيضًا على نمط من المناطق ذات LD (الهضاب أو البقع الباردة) ، متداخلة مع مناطق منخفضة LD (درجات أو نقاط ساخنة). ومع ذلك ، يجب تسليط الضوء على أن خريطة صعوبة التعلم المحاكاة الخاصة بنا توفر دليلًا على أن هذا النمط يمكن أن يعكس المناطق ذات الاختلافات في ترددات الأليل ومستوى صعوبة التعلم (المعبر عنها بـ D ') وليس المناطق ذات معدلات إعادة التركيب العالية والمنخفضة كما يتضح من Jeffreys وآخرون. [42] ، نظرًا لأن عملية المحاكاة تفترض معدل إعادة التركيب الذي يتناسب مع المسافة في سم.


التركيب الجيني واختلال التوازن في الارتباط في مجموعة تمثيلية متنوعة من نبات نموذج C4 ، الذرة الرفيعة ثنائية اللون

لتسهيل رسم خرائط الجينات في الذرة الرفيعة [Sorghum bicolor (L.) Moench] الكامنة وراء السمات المهمة اقتصاديًا ، قمنا بتحليل التركيب الوراثي واختلال التوازن في مجموعة النواة المصغرة للذرة الرفيعة المكونة من 242 سلالة محلية تحتوي على 13،390 متعدد الأشكال أحادية النوكليوتيد. تم إنتاج الأشكال المتعددة للنيوكليوتيدات المفردة باستخدام منهجية التنميط الجيني متعددة الإرسال بالتسلسل. تم إنشاء التركيب الجيني باستخدام المكون الرئيسي ، تحليل النشوء والتطور ، وتحليل الكتلة البايزية. أشارت هذه التحليلات إلى أن المجموعة المصغرة قد تم تنظيمها على أساس كل من الأصل الجغرافي وتصنيف سلالة الذرة الرفيعة. ومن الأمثلة على الأول دخول من جنوب إفريقيا وشرق آسيا واليمن. ومن الأمثلة على هذه الأخيرة الكودات ذات التوزيع الجغرافي الواسع النطاق ، والدورا من الهند ، وغينيا من غرب إفريقيا. يتجمع العرق ذو اللونين ، وهو السلالة الأكثر بدائية والأقل تحديدًا واضحًا ، بين الأجناس الأخرى ويشكل مجموعة واحدة فقط ذات لونين واضحين. أظهرت تحليلات عدم توازن الارتباط على مستوى الجينوم أن اختلال التوازن في الارتباط يتحلل ، في المتوسط ​​، في حدود 10-30 كيلو بايت ، في حين احتوى الذراع القصير لـ SBI-06 على كتلة عدم توازن للربط تبلغ 20.33 ميجا بايت ، مما يؤكد تقريرًا سابقًا عن إعادة التركيب المنخفض على ذراع الكروموسوم هذا. تم اكتشاف أربع كتل ترابط أصغر ولكنها متساوية الأهمية من 3.5 إلى 35.5 كيلو بايت على الكروموسومات 1 و 2 و 9 و 10. قمنا بفحص الجينات المشفرة داخل كل كتلة لتقديم نظرة أولية على المرشحين مثل متماثلات GS3 و FT التي قد تشير إلى عملية مسح انتقائية أثناء تدجين الذرة الرفيعة.

الكلمات الدالة: التنميط الجيني بمساعدة FseIs SNPs اختلال التوازن السلالات الذرة الرفيعة.

الأرقام

مؤامرة Scree لأجهزة الكمبيوتر (المحور X) ومساهمتها في التباين (المحور Y). سهم…

توزيع مدخلات الذرة الرفيعة المصغرة ...

توزيع مدخلات الذرة الرفيعة المصغرة على أساس ثلاثة أجهزة كمبيوتر. تم تحديد إحدى عشرة مجموعة ...

شجرة ربط الجار من الذرة الرفيعة ...

شجرة ربط الجوار لمجموعة الذرة الرفيعة المصغرة بناءً على 13،390 علامة SNP. ارى…

تحليل الهيكل. (أ) الاحتمال الخلفي ، ...

تحليل الهيكل. (أ) الاحتمال الخلفي ، ln ص ( د )، كوظيفة…

LD في الذراع القصيرة لكروموسوم الذرة الرفيعة 6. الأسهم تشير إلى LD ...

كتل اختلال التوازن الخاصة بالعرق في ...

كتل اختلال التوازن الخاصة بالعرق في الذرة الرفيعة. (أ) كتلة SBI-01 LD الخاصة بالعرق ...


اختلال التوازن - علم الأحياء

في علم الوراثة السكانية ، الربط اختلال التوازن هو الارتباط غير العشوائي للأليلات في موقعين أو أكثر ، وليس بالضرورة على نفس الكروموسوم. انها ليست هي نفسها الربط، الذي يصف ارتباط اثنين أو أكثر من المواقع على كروموسوم بمحدودية.
المقال كامل >>>

الربط اختلال التوازن (¦liŋkij dis′ēkwə′librēəm) (علم الوراثة) حدوث في مجموعة من مجموعات معينة من الأليلات المرتبطة في
المقال كامل >>>

اين هذا الربط اختلال التوازن يأتي ذلك: يقيس LD بشكل أساسي ال. الربط اختلال التوازن = المقياس السكاني الواسع للجمعيات الأليلية المتداخلة.
المقال كامل >>>

مدى وتوزيع الربط اختلال التوازن(LD) في البشر هو موضوع. ثانيا، الربط اختلال التوازن ستكون الدراسات أكثر فعالية في الكشف.
المقال كامل >>>

أظهر العمل الأخير ذلك الربط. اختلال التوازن يمكن أن تمتد على الجينوم أكبر بكثير. عدد من الدراسات الربط اختلال التوازن في الماضي .
المقال كامل >>>

الارتباط اختلال التوازن يحدث عندما تكون الأنماط الجينية في الموقعين غير مستقلة. مصطلح الربط اختلال التوازن يكون . قياس الربط اختلال التوازن .
المقال كامل >>>

ملامح التسلسل في المناطق الضعيفة والقوية الربط اختلال التوازن . مناطق عالية ومنخفضة الربط اختلال التوازن (الربعان العلوي والسفلي من.
المقال كامل >>>

الارتباط اختلال التوازن يمكن لرسم خرائط (LD) تحديد الجينات ذات التأثير الصغير بدقة. Abecasis GR، Cookson WO (2000) GOLD - نظرة عامة رسومية على الربط اختلال التوازن. .
المقال كامل >>>

للعرض الربط اختلال التوازن، تنظم MERLIN العلامات في مجموعات. . يصف هذا الملف مجموعات النيوكلوتايد في صيغة الربط اختلال التوازن. .
المقال كامل >>>

الارتباط اختلال التوازن. إذا كانت كل الأشكال المتعددة مستقلة عند. الارتباط اختلال التوازن يجعل مرتبطة بإحكام. المتغيرات ترتبط بشدة تكلفة الإنتاج.
المقال كامل >>>

الاختصارات غير القياسية المستخدمة: LD ، الربط اختلال التوازن LDU ، وحدة LD SNP ،. L ، ε) توقع الربط اختلال التوازن بين م العلامات في خريطة مادية أو.
المقال كامل >>>

الارتباط اختلال التوازن (LD) ، يُعرَّف بأنه ارتباط غير عشوائي للأليلات عند اثنين. 5. الارتباط اختلال التوازن في البشر والحيوانات.
المقال كامل >>>

الارتباط اختلال التوازن هي أداة مهمة في كل من المراحل النهائية من الوضعية. الاستدلال عن الربط اختلال التوازن لا يمكن الاعتماد عليها.
المقال كامل >>>

. ودرجة الربط اختلال التوازن في الجينوم. نظهر هذا الاختلاف في الربط اختلال التوازن يكون . الارتباط اختلال التوازن بشكل عام منخفضة في الداخل.
المقال كامل >>>

بمعنى آخر ، يحدث عندما الربط اختلال التوازن عند الصفر. . تشرح عالمة الوراثة ليندا بارتريدج مفاهيم الربط التوازن و اختلال التوازن. .
المقال كامل >>>

الارتباط اختلال التوازن بين موقعين مرتبطين تمت دراستها لفترة محدودة. تفسير الأنساب ل الارتباط اختلال التوازن .
المقال كامل >>>

. الرابطة الأليلية (يشار إليها أيضًا باسم الربط اختلال التوازن) دراستان. مثل هذا المفصل الربط و الربط اختلال التوازن كانت استراتيجية رسم الخرائط.
المقال كامل >>>

. قيم المعلمات هذه: الربط حالة توازن. D ، معامل اختلال التوازن. اضبط الترددات الأليلية الأولية وقيم اللياقة ثنائية الموضع إلى.
المقال كامل >>>


تم توفير التمويل من خلال زمالة NIGMS (GM007753) إلى NN وزمالة MHAAM إلى EH. DR هو محقق في معهد هوارد هيوز الطبي ، وقد تم دعم هذا العمل بمنح HG006399 و GM100233 من المعاهد الوطنية للصحة ، ومنحة Allen Discovery Center من مؤسسة Paul Allen ، ومنحة 61220 من مؤسسة John Templeton.

ناثان ناكاتسوكا وإيدادوين هارني هما المؤلفان الأولان المشاركان.

الانتماءات

قسم علم الوراثة ، مبنى الأبحاث الجديدة ، كلية الطب بجامعة هارفارد ، 77 Ave. Louis Pasteur ، بوسطن ، ماساتشوستس ، 02115 ، الولايات المتحدة الأمريكية

ناثان ناكاتسوكا ، إيادوين هارني ، سوابان ماليك ، ماثيو ماه ، ديفيد رايش

قسم العلوم الصحية والتكنولوجيا بجامعة هارفارد ، معهد هارفارد الطبي ، بوسطن ، ماساتشوستس ، 02115 ، الولايات المتحدة الأمريكية

قسم علم الأحياء التطوري البشري ، جامعة هارفارد ، 16 Divinity Ave. ، كامبريدج ، ماساتشوستس ، 02138 ، الولايات المتحدة الأمريكية

ناثان ناكاتسوكا ، إيادوين هارني ، سوابان ماليك ، ماثيو ماه ، نيك باترسون وأمبير ديفيد رايش

قسم الأحياء العضوية والتطورية ، جامعة هارفارد ، 16 Divinity Ave. ، كامبريدج ، ماساتشوستس ، 02138 ، الولايات المتحدة الأمريكية

معهد برود التابع لمعهد هارفارد وماساتشوستس للتكنولوجيا ، كامبريدج ، ماساتشوستس ، 02141 ، الولايات المتحدة الأمريكية

معهد هوارد هيوز الطبي ، كلية الطب بجامعة هارفارد ، بوسطن ، ماساتشوستس ، 02115 ، الولايات المتحدة الأمريكية

يمكنك أيضًا البحث عن هذا المؤلف في PubMed Google Scholar

يمكنك أيضًا البحث عن هذا المؤلف في PubMed Google Scholar

يمكنك أيضًا البحث عن هذا المؤلف في PubMed Google Scholar

يمكنك أيضًا البحث عن هذا المؤلف في PubMed Google Scholar

يمكنك أيضًا البحث عن هذا المؤلف في PubMed Google Scholar

يمكنك أيضًا البحث عن هذا المؤلف في PubMed Google Scholar

مساهمات

N.N. و E.H. و N.P. و D.R. تصور الدراسة. N.N. و E.H. و S.M. أجرى التحليل. N.N. و E.H. و D.R. كتب المخطوطة بمساعدة جميع المؤلفين المشاركين. قرأ المؤلفون المخطوطة النهائية ووافقوا عليها.

معلومات المؤلفين

مقابض تويتر:EadaoinSays (Éadaoin Harney).

المؤلفون المراسلون


نقاش

لقد قمنا بتحويل مشكلة الوراثة لتحليل اختلال التوازن في الارتباط إلى المشكلة الرياضية لتحليل الأعداد الصحيحة الموجبة إلى أجزائها المضافة ، كل ذلك مع الحفاظ على التعريف الاستكشافي المناسب لاختلال التوازن الكلي باعتباره الانحراف عن الاستقلال. على عكس G eiringer (1944) ، يمكننا كتابة صيغة صريحة لاختلال توازن الربط متعدد التركيز لأننا نستدعي أقسامًا من الأعداد الصحيحة ونعرّفها د1(أ) = العلاقات العامة (أ) ، وبذلك دمجت مفهومها عن اختلال التوازن مع مفهوم D ausset وآخرون. (1978).

إحدى النتائج المباشرة لنهج التحلل لدينا هي أن أعلى معامل واحد لاختلال التوازن ، دن، لا يمكن فحصها بمعزل عن غيرها. لأن د ن (أ ك (1) ، أ ك (2) ، ... أ ك (ن)) = ∑ باستثناء ج = (1 ، 1 ، 1 ، ... ، 1) جميع التركيبات ج من ن [Π ن ∈ ج د ni (...)] ، نحتاج إلى فحص جميع معاملات اختلال التوازن ذات الترتيب الأدنى ، دني (. ) مع نأنا & lt ن. جميع معاملات اختلال التوازن المشترك د1, د2, د3. دن يمكن أن تكون مستقلة عن بعضها البعض وكلها تساهم في دن، وهو ما نسميه بالتالي اختلال التوازن الكلي.

لم يتم استخدام التعريفات متعددة التركيز لاختلال التوازن في كثير من الأحيان في الدراسات التجريبية بسبب العدد الكبير من المدخلات ومعاملات عدم توازن الارتباط التي يجب تحليلها (2) ن - 1). في الوقت الحالي ، نادراً ما يتم قياس اختلال التوازن من الدرجة الثالثة (T homson and B aur 1984). ومع ذلك ، فإن المصطلحات الصريحة لاختلال التوازن متعدد النقاط ذات أهمية نظرية.

أحد التطبيقات النظرية الهامة هو تحليل epistasis متعدد البؤرة. طور C heverud و R outman (1995) نموذجًا ثنائي الموضع للرأفة الفسيولوجية تم تنقيحه بشكل أكبر بواسطة W agner وآخرون. (1998). لتحليل النتائج التطورية للنقمة في هذه النماذج ، يتعين على المرء أولاً تحديد اختلال التوازن لمجموعة فرعية من الموقع. وبالتالي ، لتوسيع نماذج الفسيولوجية الفسيولوجية إلى مواقع متعددة ، يجب علينا أولاً تحديد اختلال التوازن لهذه المجموعة الفرعية من المواقع ، وهو ما قمنا به للتو. ستكون نماذج الإبستاس متعددة البؤرة حاسمة في المناقشات حول العوامل التي تحافظ على المجمعات الجينية المتكيفة ، وتزيد من التباين الوراثي الإضافي ، وتعزز التنوّع (G oodnight 1988، 1995 W ade and G oodnight 1998).


شاهد الفيديو: التوازن العضلي العصبي (يوليو 2022).


تعليقات:

  1. Alafin

    من الممكن أن نقول ، هذا :) استثناء للقواعد

  2. Garadin

    جعلك لا تبتعد. ماحدث قد حدث.

  3. Cagney

    أنا آسف ، لقد تدخلت ... أنا أفهم هذا السؤال. دعونا نناقش.



اكتب رسالة